Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
Npm2Q80W85 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Npm2Q80W85 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Npm2Q80W85 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Npm2Q80W85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Npm2Q80W85 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Npm2Q80W85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Npm2Q80W85 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Npm2Q80W85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Npm2Q80W85 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Npm2Q80W85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC43■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Npm2Q80W85 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Npm2Q80W85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Npm2Q80W85 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
Npm2Q80W85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Npm2Q80W85 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Npm2Q80W85 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Npm2Q80W85 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Npm2Q80W85 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Npm2Q80W85 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Npm2Q80W85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Npm2Q80W85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Npm2Q80W85 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Npm2Q80W85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Npm2Q80W85 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Npm2Q80W85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Npm2Q80W85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Npm2Q80W85 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Npm2Q80W85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Npm2Q80W85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Npm2Q80W85 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Npm2Q80W85 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Npm2Q80W85 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Npm2Q80W85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Npm2Q80W85 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Npm2Q80W85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Npm2Q80W85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Npm2Q80W85 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Npm2Q80W85 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Npm2Q80W85 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Npm2Q80W85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Npm2Q80W85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Npm2Q80W85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Npm2Q80W85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Npm2Q80W85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Npm2Q80W85 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Npm2Q80W85 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Npm2Q80W85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Npm2Q80W85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Npm2Q80W85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Npm2Q80W85 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Npm2Q80W85 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Npm2Q80W85 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Npm2Q80W85 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Npm2Q80W85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Npm2Q80W85 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Npm2Q80W85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Npm2Q80W85 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms