Protein–RNA interactions for Protein: Q80UI7

Clec4a1, C-type lectin domain family 4, member a1, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a1Q80UI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Clec4a1Q80UI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Clec4a1Q80UI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clec4a1Q80UI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clec4a1Q80UI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clec4a1Q80UI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clec4a1Q80UI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Clec4a1Q80UI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clec4a1Q80UI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clec4a1Q80UI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clec4a1Q80UI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Clec4a1Q80UI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clec4a1Q80UI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clec4a1Q80UI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clec4a1Q80UI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clec4a1Q80UI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clec4a1Q80UI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clec4a1Q80UI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clec4a1Q80UI7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4a1Q80UI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4a1Q80UI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4a1Q80UI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clec4a1Q80UI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4a1Q80UI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clec4a1Q80UI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clec4a1Q80UI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clec4a1Q80UI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4a1Q80UI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4a1Q80UI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clec4a1Q80UI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clec4a1Q80UI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clec4a1Q80UI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clec4a1Q80UI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4a1Q80UI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4a1Q80UI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clec4a1Q80UI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4a1Q80UI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clec4a1Q80UI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4a1Q80UI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4a1Q80UI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4a1Q80UI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4a1Q80UI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4a1Q80UI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4a1Q80UI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4a1Q80UI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4a1Q80UI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a1Q80UI7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec4a1Q80UI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4a1Q80UI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4a1Q80UI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4a1Q80UI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4a1Q80UI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec4a1Q80UI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clec4a1Q80UI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4a1Q80UI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec4a1Q80UI7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4a1Q80UI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4a1Q80UI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4a1Q80UI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec4a1Q80UI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4a1Q80UI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4a1Q80UI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4a1Q80UI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4a1Q80UI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec4a1Q80UI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4a1Q80UI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec4a1Q80UI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4a1Q80UI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4a1Q80UI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec4a1Q80UI7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4a1Q80UI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec4a1Q80UI7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a1Q80UI7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec4a1Q80UI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clec4a1Q80UI7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4a1Q80UI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec4a1Q80UI7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4a1Q80UI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4a1Q80UI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4a1Q80UI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4a1Q80UI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4a1Q80UI7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4a1Q80UI7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4a1Q80UI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec4a1Q80UI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4a1Q80UI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4a1Q80UI7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4a1Q80UI7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4a1Q80UI7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4a1Q80UI7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4a1Q80UI7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec4a1Q80UI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4a1Q80UI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4a1Q80UI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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