Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Sema6dQ76KF0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema6dQ76KF0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema6dQ76KF0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema6dQ76KF0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema6dQ76KF0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema6dQ76KF0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema6dQ76KF0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema6dQ76KF0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema6dQ76KF0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema6dQ76KF0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema6dQ76KF0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6dQ76KF0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema6dQ76KF0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sema6dQ76KF0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema6dQ76KF0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sema6dQ76KF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sema6dQ76KF0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema6dQ76KF0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6dQ76KF0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6dQ76KF0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6dQ76KF0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema6dQ76KF0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema6dQ76KF0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema6dQ76KF0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6dQ76KF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6dQ76KF0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6dQ76KF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sema6dQ76KF0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6dQ76KF0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema6dQ76KF0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema6dQ76KF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema6dQ76KF0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema6dQ76KF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema6dQ76KF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema6dQ76KF0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sema6dQ76KF0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sema6dQ76KF0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sema6dQ76KF0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sema6dQ76KF0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6dQ76KF0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema6dQ76KF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema6dQ76KF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema6dQ76KF0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6dQ76KF0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6dQ76KF0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6dQ76KF0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sema6dQ76KF0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema6dQ76KF0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema6dQ76KF0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sema6dQ76KF0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema6dQ76KF0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema6dQ76KF0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sema6dQ76KF0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema6dQ76KF0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema6dQ76KF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sema6dQ76KF0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema6dQ76KF0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sema6dQ76KF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema6dQ76KF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6dQ76KF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema6dQ76KF0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema6dQ76KF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema6dQ76KF0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6dQ76KF0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6dQ76KF0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema6dQ76KF0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema6dQ76KF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema6dQ76KF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema6dQ76KF0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6dQ76KF0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema6dQ76KF0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema6dQ76KF0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema6dQ76KF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema6dQ76KF0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sema6dQ76KF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sema6dQ76KF0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sema6dQ76KF0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sema6dQ76KF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sema6dQ76KF0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sema6dQ76KF0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sema6dQ76KF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema6dQ76KF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6dQ76KF0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6dQ76KF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6dQ76KF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6dQ76KF0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6dQ76KF0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6dQ76KF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6dQ76KF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6dQ76KF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6dQ76KF0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6dQ76KF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6dQ76KF0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6dQ76KF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms