Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Nemp1Q6ZQE4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Nemp1Q6ZQE4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Nemp1Q6ZQE4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nemp1Q6ZQE4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Nemp1Q6ZQE4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Nemp1Q6ZQE4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Nemp1Q6ZQE4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Nemp1Q6ZQE4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Nemp1Q6ZQE4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nemp1Q6ZQE4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nemp1Q6ZQE4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nemp1Q6ZQE4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nemp1Q6ZQE4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nemp1Q6ZQE4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Nemp1Q6ZQE4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nemp1Q6ZQE4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nemp1Q6ZQE4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nemp1Q6ZQE4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Nemp1Q6ZQE4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nemp1Q6ZQE4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nemp1Q6ZQE4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Nemp1Q6ZQE4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nemp1Q6ZQE4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Nemp1Q6ZQE4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nemp1Q6ZQE4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nemp1Q6ZQE4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nemp1Q6ZQE4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nemp1Q6ZQE4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nemp1Q6ZQE4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nemp1Q6ZQE4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nemp1Q6ZQE4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nemp1Q6ZQE4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nemp1Q6ZQE4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nemp1Q6ZQE4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nemp1Q6ZQE4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Nemp1Q6ZQE4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nemp1Q6ZQE4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nemp1Q6ZQE4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nemp1Q6ZQE4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nemp1Q6ZQE4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nemp1Q6ZQE4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nemp1Q6ZQE4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nemp1Q6ZQE4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nemp1Q6ZQE4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nemp1Q6ZQE4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Nemp1Q6ZQE4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nemp1Q6ZQE4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nemp1Q6ZQE4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nemp1Q6ZQE4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nemp1Q6ZQE4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nemp1Q6ZQE4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nemp1Q6ZQE4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nemp1Q6ZQE4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nemp1Q6ZQE4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nemp1Q6ZQE4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nemp1Q6ZQE4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nemp1Q6ZQE4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nemp1Q6ZQE4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nemp1Q6ZQE4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nemp1Q6ZQE4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nemp1Q6ZQE4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nemp1Q6ZQE4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nemp1Q6ZQE4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nemp1Q6ZQE4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nemp1Q6ZQE4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nemp1Q6ZQE4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nemp1Q6ZQE4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nemp1Q6ZQE4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nemp1Q6ZQE4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nemp1Q6ZQE4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nemp1Q6ZQE4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nemp1Q6ZQE4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nemp1Q6ZQE4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nemp1Q6ZQE4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nemp1Q6ZQE4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nemp1Q6ZQE4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nemp1Q6ZQE4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nemp1Q6ZQE4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nemp1Q6ZQE4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nemp1Q6ZQE4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nemp1Q6ZQE4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nemp1Q6ZQE4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nemp1Q6ZQE4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nemp1Q6ZQE4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nemp1Q6ZQE4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nemp1Q6ZQE4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nemp1Q6ZQE4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nemp1Q6ZQE4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nemp1Q6ZQE4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nemp1Q6ZQE4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nemp1Q6ZQE4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nemp1Q6ZQE4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nemp1Q6ZQE4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms