Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Trak1Q6PD31 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Trak1Q6PD31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Trak1Q6PD31 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Trak1Q6PD31 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Trak1Q6PD31 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Trak1Q6PD31 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Trak1Q6PD31 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Trak1Q6PD31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Trak1Q6PD31 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Trak1Q6PD31 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Trak1Q6PD31 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Trak1Q6PD31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Trak1Q6PD31 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Trak1Q6PD31 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trak1Q6PD31 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Trak1Q6PD31 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Trak1Q6PD31 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Trak1Q6PD31 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Trak1Q6PD31 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Trak1Q6PD31 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Trak1Q6PD31 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Trak1Q6PD31 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Trak1Q6PD31 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Trak1Q6PD31 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trak1Q6PD31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Trak1Q6PD31 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Trak1Q6PD31 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Trak1Q6PD31 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Trak1Q6PD31 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Trak1Q6PD31 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Trak1Q6PD31 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Trak1Q6PD31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
Trak1Q6PD31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Trak1Q6PD31 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
Trak1Q6PD31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Trak1Q6PD31 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Trak1Q6PD31 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Trak1Q6PD31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Trak1Q6PD31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Trak1Q6PD31 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Trak1Q6PD31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Trak1Q6PD31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Trak1Q6PD31 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Trak1Q6PD31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Trak1Q6PD31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Trak1Q6PD31 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Trak1Q6PD31 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Trak1Q6PD31 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Trak1Q6PD31 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Trak1Q6PD31 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Trak1Q6PD31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Trak1Q6PD31 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Trak1Q6PD31 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Trak1Q6PD31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Trak1Q6PD31 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Trak1Q6PD31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Trak1Q6PD31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Trak1Q6PD31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Trak1Q6PD31 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Trak1Q6PD31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Trak1Q6PD31 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Trak1Q6PD31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Trak1Q6PD31 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Trak1Q6PD31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Trak1Q6PD31 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Trak1Q6PD31 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Trak1Q6PD31 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Trak1Q6PD31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Trak1Q6PD31 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Trak1Q6PD31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Trak1Q6PD31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Trak1Q6PD31 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Trak1Q6PD31 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Trak1Q6PD31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Trak1Q6PD31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Trak1Q6PD31 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Trak1Q6PD31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Trak1Q6PD31 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Trak1Q6PD31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
Trak1Q6PD31 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Trak1Q6PD31 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Trak1Q6PD31 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Trak1Q6PD31 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Trak1Q6PD31 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trak1Q6PD31 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Trak1Q6PD31 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Trak1Q6PD31 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms