Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Gm5416Q6IE28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gm5416Q6IE28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Gm5416Q6IE28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gm5416Q6IE28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm5416Q6IE28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gm5416Q6IE28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Gm5416Q6IE28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm5416Q6IE28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Gm5416Q6IE28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Gm5416Q6IE28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gm5416Q6IE28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm5416Q6IE28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm5416Q6IE28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm5416Q6IE28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm5416Q6IE28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm5416Q6IE28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gm5416Q6IE28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm5416Q6IE28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gm5416Q6IE28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm5416Q6IE28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm5416Q6IE28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm5416Q6IE28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gm5416Q6IE28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gm5416Q6IE28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gm5416Q6IE28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm5416Q6IE28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gm5416Q6IE28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm5416Q6IE28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gm5416Q6IE28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Gm5416Q6IE28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm5416Q6IE28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm5416Q6IE28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm5416Q6IE28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm5416Q6IE28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm5416Q6IE28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm5416Q6IE28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm5416Q6IE28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm5416Q6IE28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm5416Q6IE28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm5416Q6IE28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm5416Q6IE28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm5416Q6IE28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm5416Q6IE28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5416Q6IE28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm5416Q6IE28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm5416Q6IE28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm5416Q6IE28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm5416Q6IE28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm5416Q6IE28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm5416Q6IE28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm5416Q6IE28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm5416Q6IE28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5416Q6IE28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm5416Q6IE28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm5416Q6IE28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm5416Q6IE28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm5416Q6IE28 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm5416Q6IE28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5416Q6IE28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5416Q6IE28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5416Q6IE28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5416Q6IE28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm5416Q6IE28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm5416Q6IE28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5416Q6IE28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm5416Q6IE28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5416Q6IE28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5416Q6IE28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5416Q6IE28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm5416Q6IE28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5416Q6IE28 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5416Q6IE28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5416Q6IE28 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm5416Q6IE28 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5416Q6IE28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5416Q6IE28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm5416Q6IE28 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5416Q6IE28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5416Q6IE28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5416Q6IE28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5416Q6IE28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5416Q6IE28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5416Q6IE28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5416Q6IE28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5416Q6IE28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5416Q6IE28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5416Q6IE28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5416Q6IE28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5416Q6IE28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5416Q6IE28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5416Q6IE28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5416Q6IE28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm5416Q6IE28 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5416Q6IE28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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