Protein–RNA interactions for Protein: Q64018

Glra1, Glycine receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glra1Q64018 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Glra1Q64018 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Glra1Q64018 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Glra1Q64018 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Glra1Q64018 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Glra1Q64018 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Glra1Q64018 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Glra1Q64018 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Glra1Q64018 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Glra1Q64018 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Glra1Q64018 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Glra1Q64018 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Glra1Q64018 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Glra1Q64018 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Glra1Q64018 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Glra1Q64018 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Glra1Q64018 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Glra1Q64018 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Glra1Q64018 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Glra1Q64018 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Glra1Q64018 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Glra1Q64018 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Glra1Q64018 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Glra1Q64018 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Glra1Q64018 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Glra1Q64018 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Glra1Q64018 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Glra1Q64018 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Glra1Q64018 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Glra1Q64018 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Glra1Q64018 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Glra1Q64018 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Glra1Q64018 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Glra1Q64018 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Glra1Q64018 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Glra1Q64018 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Glra1Q64018 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Glra1Q64018 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Glra1Q64018 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Glra1Q64018 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Glra1Q64018 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Glra1Q64018 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Glra1Q64018 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Glra1Q64018 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Glra1Q64018 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Glra1Q64018 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Glra1Q64018 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Glra1Q64018 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Glra1Q64018 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Glra1Q64018 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Glra1Q64018 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Glra1Q64018 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Glra1Q64018 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Glra1Q64018 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Glra1Q64018 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Glra1Q64018 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Glra1Q64018 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Glra1Q64018 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glra1Q64018 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glra1Q64018 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glra1Q64018 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glra1Q64018 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glra1Q64018 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Glra1Q64018 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glra1Q64018 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Glra1Q64018 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Glra1Q64018 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Glra1Q64018 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Glra1Q64018 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Glra1Q64018 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Glra1Q64018 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Glra1Q64018 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Glra1Q64018 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Glra1Q64018 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Glra1Q64018 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Glra1Q64018 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Glra1Q64018 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Glra1Q64018 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Glra1Q64018 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Glra1Q64018 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Glra1Q64018 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Glra1Q64018 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glra1Q64018 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Glra1Q64018 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glra1Q64018 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glra1Q64018 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Glra1Q64018 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Glra1Q64018 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms