Protein–RNA interactions for Protein: Q62296

Tead4, Transcriptional enhancer factor TEF-3, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tead4Q62296 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Tead4Q62296 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tead4Q62296 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tead4Q62296 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Tead4Q62296 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tead4Q62296 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tead4Q62296 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Tead4Q62296 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Tead4Q62296 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tead4Q62296 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Tead4Q62296 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Tead4Q62296 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tead4Q62296 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Tead4Q62296 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tead4Q62296 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tead4Q62296 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tead4Q62296 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Tead4Q62296 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tead4Q62296 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tead4Q62296 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tead4Q62296 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tead4Q62296 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tead4Q62296 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tead4Q62296 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tead4Q62296 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tead4Q62296 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tead4Q62296 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Tead4Q62296 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tead4Q62296 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Tead4Q62296 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tead4Q62296 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tead4Q62296 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tead4Q62296 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tead4Q62296 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tead4Q62296 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Tead4Q62296 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tead4Q62296 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tead4Q62296 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tead4Q62296 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tead4Q62296 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tead4Q62296 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tead4Q62296 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tead4Q62296 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tead4Q62296 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tead4Q62296 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tead4Q62296 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Tead4Q62296 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tead4Q62296 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tead4Q62296 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tead4Q62296 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tead4Q62296 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tead4Q62296 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tead4Q62296 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tead4Q62296 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tead4Q62296 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tead4Q62296 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tead4Q62296 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tead4Q62296 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tead4Q62296 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tead4Q62296 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tead4Q62296 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tead4Q62296 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tead4Q62296 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tead4Q62296 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tead4Q62296 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tead4Q62296 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tead4Q62296 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tead4Q62296 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tead4Q62296 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tead4Q62296 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tead4Q62296 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tead4Q62296 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tead4Q62296 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tead4Q62296 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tead4Q62296 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tead4Q62296 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tead4Q62296 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tead4Q62296 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tead4Q62296 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tead4Q62296 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tead4Q62296 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tead4Q62296 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tead4Q62296 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tead4Q62296 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tead4Q62296 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tead4Q62296 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tead4Q62296 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tead4Q62296 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tead4Q62296 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tead4Q62296 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tead4Q62296 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tead4Q62296 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tead4Q62296 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tead4Q62296 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tead4Q62296 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tead4Q62296 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tead4Q62296 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tead4Q62296 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tead4Q62296 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tead4Q62296 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms