Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Sema5aQ62217 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Sema5aQ62217 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Sema5aQ62217 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Sema5aQ62217 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sema5aQ62217 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sema5aQ62217 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Sema5aQ62217 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Sema5aQ62217 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sema5aQ62217 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema5aQ62217 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sema5aQ62217 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Sema5aQ62217 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Sema5aQ62217 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Sema5aQ62217 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sema5aQ62217 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sema5aQ62217 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sema5aQ62217 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sema5aQ62217 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sema5aQ62217 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sema5aQ62217 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sema5aQ62217 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sema5aQ62217 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sema5aQ62217 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sema5aQ62217 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sema5aQ62217 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sema5aQ62217 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Sema5aQ62217 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Sema5aQ62217 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sema5aQ62217 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sema5aQ62217 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sema5aQ62217 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sema5aQ62217 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sema5aQ62217 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sema5aQ62217 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sema5aQ62217 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sema5aQ62217 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sema5aQ62217 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sema5aQ62217 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sema5aQ62217 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sema5aQ62217 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Sema5aQ62217 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sema5aQ62217 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sema5aQ62217 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sema5aQ62217 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sema5aQ62217 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sema5aQ62217 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sema5aQ62217 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sema5aQ62217 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sema5aQ62217 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sema5aQ62217 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sema5aQ62217 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sema5aQ62217 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sema5aQ62217 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sema5aQ62217 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sema5aQ62217 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sema5aQ62217 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sema5aQ62217 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Sema5aQ62217 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sema5aQ62217 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sema5aQ62217 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sema5aQ62217 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema5aQ62217 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema5aQ62217 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sema5aQ62217 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Sema5aQ62217 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sema5aQ62217 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sema5aQ62217 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sema5aQ62217 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sema5aQ62217 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sema5aQ62217 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sema5aQ62217 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sema5aQ62217 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sema5aQ62217 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sema5aQ62217 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sema5aQ62217 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sema5aQ62217 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sema5aQ62217 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sema5aQ62217 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sema5aQ62217 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sema5aQ62217 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sema5aQ62217 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema5aQ62217 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema5aQ62217 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sema5aQ62217 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema5aQ62217 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema5aQ62217 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sema5aQ62217 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema5aQ62217 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema5aQ62217 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema5aQ62217 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema5aQ62217 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sema5aQ62217 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema5aQ62217 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema5aQ62217 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms