Protein–RNA interactions for Protein: Q61334

Bcap29, B-cell receptor-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcap29Q61334 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Bcap29Q61334 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Bcap29Q61334 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcap29Q61334 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bcap29Q61334 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bcap29Q61334 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcap29Q61334 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Bcap29Q61334 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Bcap29Q61334 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bcap29Q61334 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Bcap29Q61334 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcap29Q61334 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Bcap29Q61334 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcap29Q61334 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcap29Q61334 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bcap29Q61334 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bcap29Q61334 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Bcap29Q61334 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bcap29Q61334 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bcap29Q61334 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bcap29Q61334 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Bcap29Q61334 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bcap29Q61334 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bcap29Q61334 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Bcap29Q61334 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcap29Q61334 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcap29Q61334 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcap29Q61334 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcap29Q61334 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcap29Q61334 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcap29Q61334 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcap29Q61334 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcap29Q61334 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcap29Q61334 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcap29Q61334 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcap29Q61334 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcap29Q61334 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcap29Q61334 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcap29Q61334 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcap29Q61334 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcap29Q61334 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcap29Q61334 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcap29Q61334 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcap29Q61334 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcap29Q61334 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bcap29Q61334 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcap29Q61334 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bcap29Q61334 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcap29Q61334 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcap29Q61334 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcap29Q61334 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcap29Q61334 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcap29Q61334 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcap29Q61334 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcap29Q61334 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcap29Q61334 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bcap29Q61334 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bcap29Q61334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bcap29Q61334 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bcap29Q61334 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcap29Q61334 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcap29Q61334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcap29Q61334 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcap29Q61334 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcap29Q61334 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcap29Q61334 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcap29Q61334 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcap29Q61334 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcap29Q61334 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bcap29Q61334 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bcap29Q61334 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bcap29Q61334 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bcap29Q61334 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bcap29Q61334 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bcap29Q61334 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcap29Q61334 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcap29Q61334 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcap29Q61334 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bcap29Q61334 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcap29Q61334 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcap29Q61334 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcap29Q61334 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcap29Q61334 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcap29Q61334 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcap29Q61334 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcap29Q61334 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcap29Q61334 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bcap29Q61334 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcap29Q61334 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bcap29Q61334 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bcap29Q61334 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcap29Q61334 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcap29Q61334 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcap29Q61334 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bcap29Q61334 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcap29Q61334 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcap29Q61334 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcap29Q61334 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcap29Q61334 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcap29Q61334 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms