Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Spin1Q61142 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Spin1Q61142 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Spin1Q61142 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Spin1Q61142 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Spin1Q61142 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Spin1Q61142 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Spin1Q61142 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Spin1Q61142 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Spin1Q61142 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Spin1Q61142 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spin1Q61142 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Spin1Q61142 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spin1Q61142 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spin1Q61142 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spin1Q61142 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Spin1Q61142 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Spin1Q61142 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spin1Q61142 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spin1Q61142 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Spin1Q61142 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spin1Q61142 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spin1Q61142 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spin1Q61142 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spin1Q61142 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spin1Q61142 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spin1Q61142 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spin1Q61142 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spin1Q61142 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spin1Q61142 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spin1Q61142 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spin1Q61142 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spin1Q61142 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Spin1Q61142 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spin1Q61142 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spin1Q61142 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spin1Q61142 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spin1Q61142 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spin1Q61142 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Spin1Q61142 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spin1Q61142 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spin1Q61142 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Spin1Q61142 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Spin1Q61142 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Spin1Q61142 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spin1Q61142 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spin1Q61142 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spin1Q61142 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spin1Q61142 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spin1Q61142 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spin1Q61142 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spin1Q61142 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Spin1Q61142 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spin1Q61142 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spin1Q61142 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spin1Q61142 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spin1Q61142 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spin1Q61142 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Spin1Q61142 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spin1Q61142 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spin1Q61142 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spin1Q61142 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spin1Q61142 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Spin1Q61142 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spin1Q61142 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spin1Q61142 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spin1Q61142 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spin1Q61142 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spin1Q61142 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Spin1Q61142 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spin1Q61142 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spin1Q61142 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spin1Q61142 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Spin1Q61142 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Spin1Q61142 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Spin1Q61142 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Spin1Q61142 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Spin1Q61142 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spin1Q61142 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spin1Q61142 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spin1Q61142 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spin1Q61142 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Spin1Q61142 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spin1Q61142 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Spin1Q61142 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spin1Q61142 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Spin1Q61142 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spin1Q61142 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spin1Q61142 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spin1Q61142 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spin1Q61142 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spin1Q61142 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spin1Q61142 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spin1Q61142 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spin1Q61142 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms