Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Lhfpl4Q5U4E0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lhfpl4Q5U4E0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lhfpl4Q5U4E0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lhfpl4Q5U4E0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lhfpl4Q5U4E0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lhfpl4Q5U4E0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lhfpl4Q5U4E0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lhfpl4Q5U4E0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lhfpl4Q5U4E0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lhfpl4Q5U4E0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lhfpl4Q5U4E0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lhfpl4Q5U4E0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lhfpl4Q5U4E0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lhfpl4Q5U4E0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lhfpl4Q5U4E0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lhfpl4Q5U4E0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lhfpl4Q5U4E0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhfpl4Q5U4E0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lhfpl4Q5U4E0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lhfpl4Q5U4E0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lhfpl4Q5U4E0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lhfpl4Q5U4E0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lhfpl4Q5U4E0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lhfpl4Q5U4E0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhfpl4Q5U4E0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lhfpl4Q5U4E0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lhfpl4Q5U4E0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lhfpl4Q5U4E0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhfpl4Q5U4E0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhfpl4Q5U4E0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lhfpl4Q5U4E0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lhfpl4Q5U4E0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lhfpl4Q5U4E0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lhfpl4Q5U4E0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhfpl4Q5U4E0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhfpl4Q5U4E0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhfpl4Q5U4E0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhfpl4Q5U4E0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lhfpl4Q5U4E0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lhfpl4Q5U4E0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhfpl4Q5U4E0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhfpl4Q5U4E0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhfpl4Q5U4E0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhfpl4Q5U4E0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhfpl4Q5U4E0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhfpl4Q5U4E0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhfpl4Q5U4E0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhfpl4Q5U4E0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhfpl4Q5U4E0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhfpl4Q5U4E0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhfpl4Q5U4E0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhfpl4Q5U4E0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhfpl4Q5U4E0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lhfpl4Q5U4E0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhfpl4Q5U4E0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhfpl4Q5U4E0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhfpl4Q5U4E0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhfpl4Q5U4E0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhfpl4Q5U4E0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhfpl4Q5U4E0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhfpl4Q5U4E0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhfpl4Q5U4E0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhfpl4Q5U4E0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhfpl4Q5U4E0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhfpl4Q5U4E0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhfpl4Q5U4E0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhfpl4Q5U4E0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhfpl4Q5U4E0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhfpl4Q5U4E0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhfpl4Q5U4E0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhfpl4Q5U4E0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhfpl4Q5U4E0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms