Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Vmn1r196Q5SVD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Vmn1r196Q5SVD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vmn1r196Q5SVD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Vmn1r196Q5SVD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Vmn1r196Q5SVD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r196Q5SVD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Vmn1r196Q5SVD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn1r196Q5SVD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vmn1r196Q5SVD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r196Q5SVD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vmn1r196Q5SVD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vmn1r196Q5SVD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn1r196Q5SVD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r196Q5SVD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vmn1r196Q5SVD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vmn1r196Q5SVD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r196Q5SVD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r196Q5SVD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r196Q5SVD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r196Q5SVD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r196Q5SVD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vmn1r196Q5SVD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r196Q5SVD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vmn1r196Q5SVD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r196Q5SVD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn1r196Q5SVD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r196Q5SVD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r196Q5SVD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn1r196Q5SVD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r196Q5SVD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r196Q5SVD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r196Q5SVD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r196Q5SVD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r196Q5SVD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r196Q5SVD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r196Q5SVD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r196Q5SVD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r196Q5SVD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r196Q5SVD5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r196Q5SVD5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vmn1r196Q5SVD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r196Q5SVD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vmn1r196Q5SVD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r196Q5SVD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r196Q5SVD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vmn1r196Q5SVD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r196Q5SVD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms