Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL66

Psg28, Pregnancy-specific glycoprotein 28, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg28Q4KL66 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Psg28Q4KL66 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Psg28Q4KL66 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Psg28Q4KL66 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Psg28Q4KL66 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Psg28Q4KL66 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Psg28Q4KL66 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Psg28Q4KL66 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Psg28Q4KL66 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Psg28Q4KL66 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Psg28Q4KL66 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Psg28Q4KL66 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Psg28Q4KL66 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Psg28Q4KL66 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Psg28Q4KL66 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Psg28Q4KL66 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Psg28Q4KL66 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psg28Q4KL66 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Psg28Q4KL66 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psg28Q4KL66 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psg28Q4KL66 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psg28Q4KL66 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psg28Q4KL66 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Psg28Q4KL66 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psg28Q4KL66 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Psg28Q4KL66 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psg28Q4KL66 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Psg28Q4KL66 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Psg28Q4KL66 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Psg28Q4KL66 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Psg28Q4KL66 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Psg28Q4KL66 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Psg28Q4KL66 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Psg28Q4KL66 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psg28Q4KL66 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Psg28Q4KL66 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psg28Q4KL66 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Psg28Q4KL66 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Psg28Q4KL66 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psg28Q4KL66 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Psg28Q4KL66 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Psg28Q4KL66 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Psg28Q4KL66 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psg28Q4KL66 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Psg28Q4KL66 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Psg28Q4KL66 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psg28Q4KL66 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Psg28Q4KL66 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Psg28Q4KL66 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Psg28Q4KL66 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Psg28Q4KL66 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Psg28Q4KL66 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Psg28Q4KL66 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Psg28Q4KL66 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Psg28Q4KL66 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Psg28Q4KL66 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Psg28Q4KL66 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Psg28Q4KL66 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Psg28Q4KL66 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Psg28Q4KL66 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Psg28Q4KL66 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Psg28Q4KL66 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Psg28Q4KL66 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Psg28Q4KL66 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Psg28Q4KL66 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Psg28Q4KL66 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Psg28Q4KL66 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Psg28Q4KL66 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Psg28Q4KL66 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psg28Q4KL66 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Psg28Q4KL66 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Psg28Q4KL66 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psg28Q4KL66 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Psg28Q4KL66 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Psg28Q4KL66 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Psg28Q4KL66 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psg28Q4KL66 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Psg28Q4KL66 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psg28Q4KL66 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Psg28Q4KL66 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psg28Q4KL66 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psg28Q4KL66 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Psg28Q4KL66 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psg28Q4KL66 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Psg28Q4KL66 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psg28Q4KL66 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psg28Q4KL66 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psg28Q4KL66 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psg28Q4KL66 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psg28Q4KL66 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms