Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Pdp1Q3UV70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdp1Q3UV70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdp1Q3UV70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pdp1Q3UV70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdp1Q3UV70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdp1Q3UV70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdp1Q3UV70 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdp1Q3UV70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdp1Q3UV70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdp1Q3UV70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pdp1Q3UV70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdp1Q3UV70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdp1Q3UV70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdp1Q3UV70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdp1Q3UV70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdp1Q3UV70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdp1Q3UV70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdp1Q3UV70 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdp1Q3UV70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdp1Q3UV70 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pdp1Q3UV70 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdp1Q3UV70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdp1Q3UV70 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdp1Q3UV70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdp1Q3UV70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdp1Q3UV70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdp1Q3UV70 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdp1Q3UV70 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdp1Q3UV70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdp1Q3UV70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdp1Q3UV70 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdp1Q3UV70 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdp1Q3UV70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdp1Q3UV70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdp1Q3UV70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdp1Q3UV70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdp1Q3UV70 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdp1Q3UV70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdp1Q3UV70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdp1Q3UV70 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdp1Q3UV70 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdp1Q3UV70 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdp1Q3UV70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdp1Q3UV70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdp1Q3UV70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdp1Q3UV70 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdp1Q3UV70 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdp1Q3UV70 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdp1Q3UV70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdp1Q3UV70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdp1Q3UV70 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdp1Q3UV70 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdp1Q3UV70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdp1Q3UV70 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdp1Q3UV70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdp1Q3UV70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdp1Q3UV70 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdp1Q3UV70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdp1Q3UV70 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdp1Q3UV70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdp1Q3UV70 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdp1Q3UV70 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdp1Q3UV70 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdp1Q3UV70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdp1Q3UV70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdp1Q3UV70 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdp1Q3UV70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdp1Q3UV70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdp1Q3UV70 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdp1Q3UV70 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdp1Q3UV70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdp1Q3UV70 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdp1Q3UV70 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pdp1Q3UV70 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pdp1Q3UV70 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdp1Q3UV70 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdp1Q3UV70 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdp1Q3UV70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdp1Q3UV70 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdp1Q3UV70 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp1Q3UV70 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp1Q3UV70 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp1Q3UV70 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp1Q3UV70 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp1Q3UV70 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp1Q3UV70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdp1Q3UV70 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdp1Q3UV70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdp1Q3UV70 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdp1Q3UV70 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdp1Q3UV70 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdp1Q3UV70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdp1Q3UV70 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms