Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Elf3Q3UPW2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Elf3Q3UPW2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Elf3Q3UPW2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Elf3Q3UPW2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Elf3Q3UPW2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Elf3Q3UPW2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Elf3Q3UPW2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Elf3Q3UPW2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Elf3Q3UPW2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Elf3Q3UPW2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Elf3Q3UPW2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Elf3Q3UPW2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Elf3Q3UPW2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Elf3Q3UPW2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Elf3Q3UPW2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Elf3Q3UPW2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Elf3Q3UPW2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Elf3Q3UPW2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Elf3Q3UPW2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Elf3Q3UPW2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Elf3Q3UPW2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Elf3Q3UPW2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Elf3Q3UPW2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Elf3Q3UPW2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Elf3Q3UPW2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Elf3Q3UPW2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Elf3Q3UPW2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Elf3Q3UPW2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Elf3Q3UPW2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Elf3Q3UPW2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Elf3Q3UPW2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Elf3Q3UPW2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Elf3Q3UPW2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Elf3Q3UPW2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Elf3Q3UPW2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Elf3Q3UPW2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Elf3Q3UPW2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Elf3Q3UPW2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Elf3Q3UPW2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Elf3Q3UPW2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Elf3Q3UPW2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Elf3Q3UPW2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Elf3Q3UPW2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Elf3Q3UPW2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Elf3Q3UPW2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Elf3Q3UPW2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Elf3Q3UPW2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Elf3Q3UPW2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Elf3Q3UPW2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Elf3Q3UPW2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Elf3Q3UPW2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Elf3Q3UPW2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Elf3Q3UPW2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Elf3Q3UPW2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Elf3Q3UPW2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Elf3Q3UPW2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Elf3Q3UPW2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Elf3Q3UPW2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Elf3Q3UPW2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Elf3Q3UPW2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Elf3Q3UPW2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Elf3Q3UPW2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Elf3Q3UPW2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Elf3Q3UPW2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Elf3Q3UPW2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Elf3Q3UPW2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Elf3Q3UPW2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Elf3Q3UPW2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Elf3Q3UPW2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Elf3Q3UPW2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Elf3Q3UPW2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Elf3Q3UPW2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Elf3Q3UPW2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Elf3Q3UPW2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Elf3Q3UPW2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Elf3Q3UPW2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Elf3Q3UPW2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Elf3Q3UPW2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Elf3Q3UPW2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Elf3Q3UPW2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Elf3Q3UPW2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Elf3Q3UPW2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Elf3Q3UPW2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Elf3Q3UPW2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Elf3Q3UPW2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Elf3Q3UPW2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Elf3Q3UPW2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Elf3Q3UPW2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Elf3Q3UPW2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Elf3Q3UPW2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Elf3Q3UPW2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Elf3Q3UPW2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Elf3Q3UPW2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elf3Q3UPW2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Elf3Q3UPW2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Elf3Q3UPW2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Elf3Q3UPW2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elf3Q3UPW2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Elf3Q3UPW2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms