Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQI7

Telomere length and silencing protein 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQI7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Q3TQI7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Q3TQI7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Q3TQI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Q3TQI7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Q3TQI7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Q3TQI7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Q3TQI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Q3TQI7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Q3TQI7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Q3TQI7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Q3TQI7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Q3TQI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Q3TQI7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Q3TQI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Q3TQI7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Q3TQI7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Q3TQI7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Q3TQI7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Q3TQI7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Q3TQI7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Q3TQI7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Q3TQI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Q3TQI7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Q3TQI7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Q3TQI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Q3TQI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Q3TQI7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Q3TQI7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Q3TQI7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Q3TQI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Q3TQI7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Q3TQI7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Q3TQI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Q3TQI7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Q3TQI7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Q3TQI7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Q3TQI7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Q3TQI7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Q3TQI7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Q3TQI7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Q3TQI7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Q3TQI7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Q3TQI7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Q3TQI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Q3TQI7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Q3TQI7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Q3TQI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Q3TQI7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Q3TQI7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Q3TQI7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Q3TQI7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Q3TQI7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Q3TQI7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Q3TQI7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Q3TQI7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Q3TQI7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Q3TQI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Q3TQI7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Q3TQI7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Q3TQI7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Q3TQI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Q3TQI7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Q3TQI7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Q3TQI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Q3TQI7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Q3TQI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Q3TQI7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Q3TQI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Q3TQI7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Q3TQI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Q3TQI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Q3TQI7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Q3TQI7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Q3TQI7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Q3TQI7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Q3TQI7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms