Protein–RNA interactions for Protein: Q14DH7

Acss3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss3Q14DH7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Acss3Q14DH7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Acss3Q14DH7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Acss3Q14DH7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Acss3Q14DH7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Acss3Q14DH7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Acss3Q14DH7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Acss3Q14DH7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Acss3Q14DH7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Acss3Q14DH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Acss3Q14DH7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Acss3Q14DH7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Acss3Q14DH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Acss3Q14DH7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Acss3Q14DH7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Acss3Q14DH7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Acss3Q14DH7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Acss3Q14DH7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Acss3Q14DH7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acss3Q14DH7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Acss3Q14DH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Acss3Q14DH7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Acss3Q14DH7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Acss3Q14DH7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Acss3Q14DH7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Acss3Q14DH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Acss3Q14DH7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Acss3Q14DH7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Acss3Q14DH7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Acss3Q14DH7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Acss3Q14DH7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Acss3Q14DH7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acss3Q14DH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Acss3Q14DH7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Acss3Q14DH7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Acss3Q14DH7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Acss3Q14DH7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acss3Q14DH7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Acss3Q14DH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Acss3Q14DH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Acss3Q14DH7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Acss3Q14DH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Acss3Q14DH7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acss3Q14DH7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Acss3Q14DH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Acss3Q14DH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Acss3Q14DH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Acss3Q14DH7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Acss3Q14DH7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Acss3Q14DH7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Acss3Q14DH7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Acss3Q14DH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Acss3Q14DH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Acss3Q14DH7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Acss3Q14DH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Acss3Q14DH7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Acss3Q14DH7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Acss3Q14DH7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acss3Q14DH7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Acss3Q14DH7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acss3Q14DH7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Acss3Q14DH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Acss3Q14DH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Acss3Q14DH7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Acss3Q14DH7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Acss3Q14DH7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Acss3Q14DH7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Acss3Q14DH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Acss3Q14DH7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Acss3Q14DH7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Acss3Q14DH7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Acss3Q14DH7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Acss3Q14DH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Acss3Q14DH7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Acss3Q14DH7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Acss3Q14DH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Acss3Q14DH7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Acss3Q14DH7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Acss3Q14DH7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acss3Q14DH7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acss3Q14DH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acss3Q14DH7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Acss3Q14DH7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Acss3Q14DH7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Acss3Q14DH7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Acss3Q14DH7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acss3Q14DH7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Acss3Q14DH7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Acss3Q14DH7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acss3Q14DH7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acss3Q14DH7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Acss3Q14DH7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Acss3Q14DH7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acss3Q14DH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Acss3Q14DH7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acss3Q14DH7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acss3Q14DH7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acss3Q14DH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acss3Q14DH7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acss3Q14DH7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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