Protein–RNA interactions for Protein: Q11127

Fut4, Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fut4Q11127 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Fut4Q11127 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fut4Q11127 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fut4Q11127 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Fut4Q11127 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fut4Q11127 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fut4Q11127 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fut4Q11127 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Fut4Q11127 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Fut4Q11127 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fut4Q11127 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fut4Q11127 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fut4Q11127 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fut4Q11127 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fut4Q11127 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fut4Q11127 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fut4Q11127 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fut4Q11127 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fut4Q11127 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fut4Q11127 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fut4Q11127 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fut4Q11127 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fut4Q11127 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fut4Q11127 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fut4Q11127 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fut4Q11127 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fut4Q11127 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fut4Q11127 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fut4Q11127 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fut4Q11127 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fut4Q11127 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fut4Q11127 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fut4Q11127 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fut4Q11127 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fut4Q11127 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fut4Q11127 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Fut4Q11127 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fut4Q11127 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fut4Q11127 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fut4Q11127 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fut4Q11127 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fut4Q11127 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fut4Q11127 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fut4Q11127 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fut4Q11127 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fut4Q11127 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fut4Q11127 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fut4Q11127 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fut4Q11127 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fut4Q11127 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fut4Q11127 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fut4Q11127 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fut4Q11127 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fut4Q11127 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fut4Q11127 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fut4Q11127 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fut4Q11127 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fut4Q11127 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fut4Q11127 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fut4Q11127 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fut4Q11127 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fut4Q11127 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fut4Q11127 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fut4Q11127 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fut4Q11127 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fut4Q11127 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fut4Q11127 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fut4Q11127 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fut4Q11127 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fut4Q11127 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fut4Q11127 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fut4Q11127 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fut4Q11127 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fut4Q11127 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fut4Q11127 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fut4Q11127 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fut4Q11127 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fut4Q11127 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fut4Q11127 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fut4Q11127 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fut4Q11127 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fut4Q11127 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fut4Q11127 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fut4Q11127 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fut4Q11127 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fut4Q11127 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fut4Q11127 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fut4Q11127 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fut4Q11127 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fut4Q11127 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fut4Q11127 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fut4Q11127 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fut4Q11127 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fut4Q11127 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fut4Q11127 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fut4Q11127 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fut4Q11127 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fut4Q11127 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fut4Q11127 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fut4Q11127 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms