Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Rundc1Q0VDN7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Rundc1Q0VDN7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rundc1Q0VDN7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rundc1Q0VDN7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rundc1Q0VDN7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rundc1Q0VDN7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Rundc1Q0VDN7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rundc1Q0VDN7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Rundc1Q0VDN7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rundc1Q0VDN7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Rundc1Q0VDN7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Rundc1Q0VDN7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
Rundc1Q0VDN7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rundc1Q0VDN7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rundc1Q0VDN7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Rundc1Q0VDN7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rundc1Q0VDN7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rundc1Q0VDN7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Rundc1Q0VDN7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rundc1Q0VDN7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rundc1Q0VDN7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Rundc1Q0VDN7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rundc1Q0VDN7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rundc1Q0VDN7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rundc1Q0VDN7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rundc1Q0VDN7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Rundc1Q0VDN7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Rundc1Q0VDN7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Rundc1Q0VDN7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rundc1Q0VDN7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Rundc1Q0VDN7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Rundc1Q0VDN7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rundc1Q0VDN7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Rundc1Q0VDN7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rundc1Q0VDN7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Rundc1Q0VDN7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Rundc1Q0VDN7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Rundc1Q0VDN7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Rundc1Q0VDN7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rundc1Q0VDN7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rundc1Q0VDN7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Rundc1Q0VDN7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Rundc1Q0VDN7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rundc1Q0VDN7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rundc1Q0VDN7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rundc1Q0VDN7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Rundc1Q0VDN7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rundc1Q0VDN7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rundc1Q0VDN7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rundc1Q0VDN7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rundc1Q0VDN7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rundc1Q0VDN7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rundc1Q0VDN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Rundc1Q0VDN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Rundc1Q0VDN7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rundc1Q0VDN7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rundc1Q0VDN7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rundc1Q0VDN7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rundc1Q0VDN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rundc1Q0VDN7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rundc1Q0VDN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rundc1Q0VDN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rundc1Q0VDN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rundc1Q0VDN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rundc1Q0VDN7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rundc1Q0VDN7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rundc1Q0VDN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Rundc1Q0VDN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Rundc1Q0VDN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Rundc1Q0VDN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rundc1Q0VDN7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rundc1Q0VDN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rundc1Q0VDN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rundc1Q0VDN7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rundc1Q0VDN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rundc1Q0VDN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rundc1Q0VDN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Rundc1Q0VDN7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Rundc1Q0VDN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rundc1Q0VDN7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rundc1Q0VDN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Rundc1Q0VDN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rundc1Q0VDN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rundc1Q0VDN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms