Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rab42Q0PD08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rab42Q0PD08 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rab42Q0PD08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rab42Q0PD08 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab42Q0PD08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab42Q0PD08 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab42Q0PD08 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab42Q0PD08 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab42Q0PD08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab42Q0PD08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab42Q0PD08 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab42Q0PD08 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab42Q0PD08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab42Q0PD08 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab42Q0PD08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab42Q0PD08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab42Q0PD08 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab42Q0PD08 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab42Q0PD08 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rab42Q0PD08 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rab42Q0PD08 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rab42Q0PD08 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab42Q0PD08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rab42Q0PD08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rab42Q0PD08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab42Q0PD08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rab42Q0PD08 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab42Q0PD08 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab42Q0PD08 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab42Q0PD08 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab42Q0PD08 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab42Q0PD08 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab42Q0PD08 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab42Q0PD08 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab42Q0PD08 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab42Q0PD08 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab42Q0PD08 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab42Q0PD08 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab42Q0PD08 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab42Q0PD08 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab42Q0PD08 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab42Q0PD08 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab42Q0PD08 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab42Q0PD08 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab42Q0PD08 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab42Q0PD08 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab42Q0PD08 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab42Q0PD08 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab42Q0PD08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab42Q0PD08 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab42Q0PD08 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab42Q0PD08 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab42Q0PD08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab42Q0PD08 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab42Q0PD08 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab42Q0PD08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab42Q0PD08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab42Q0PD08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab42Q0PD08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab42Q0PD08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab42Q0PD08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab42Q0PD08 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab42Q0PD08 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab42Q0PD08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab42Q0PD08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab42Q0PD08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab42Q0PD08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab42Q0PD08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab42Q0PD08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab42Q0PD08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab42Q0PD08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab42Q0PD08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab42Q0PD08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab42Q0PD08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab42Q0PD08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab42Q0PD08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab42Q0PD08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab42Q0PD08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab42Q0PD08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab42Q0PD08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab42Q0PD08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab42Q0PD08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab42Q0PD08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab42Q0PD08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab42Q0PD08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab42Q0PD08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab42Q0PD08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab42Q0PD08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab42Q0PD08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab42Q0PD08 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab42Q0PD08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab42Q0PD08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab42Q0PD08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab42Q0PD08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms