Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
Lrriq1Q0P5X1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Lrriq1Q0P5X1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Lrriq1Q0P5X1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Lrriq1Q0P5X1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC48■■■■■ 5.27
Lrriq1Q0P5X1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
Lrriq1Q0P5X1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Lrriq1Q0P5X1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
Lrriq1Q0P5X1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Lrriq1Q0P5X1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47.75■■■■■ 5.23
Lrriq1Q0P5X1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Lrriq1Q0P5X1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Lrriq1Q0P5X1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Lrriq1Q0P5X1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Lrriq1Q0P5X1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC47.54■■■■■ 5.2
Lrriq1Q0P5X1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
Lrriq1Q0P5X1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
Lrriq1Q0P5X1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Lrriq1Q0P5X1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
Lrriq1Q0P5X1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
Lrriq1Q0P5X1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
Lrriq1Q0P5X1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.15
Lrriq1Q0P5X1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
Lrriq1Q0P5X1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Lrriq1Q0P5X1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Lrriq1Q0P5X1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Lrriq1Q0P5X1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Lrriq1Q0P5X1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
Lrriq1Q0P5X1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Lrriq1Q0P5X1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Lrriq1Q0P5X1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.87■■■■■ 5.09
Lrriq1Q0P5X1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
Lrriq1Q0P5X1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Lrriq1Q0P5X1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
Lrriq1Q0P5X1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Lrriq1Q0P5X1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
Lrriq1Q0P5X1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Lrriq1Q0P5X1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Lrriq1Q0P5X1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC46.72■■■■■ 5.07
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.67■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC46.65■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
Lrriq1Q0P5X1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Lrriq1Q0P5X1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
Lrriq1Q0P5X1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
Lrriq1Q0P5X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Lrriq1Q0P5X1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Lrriq1Q0P5X1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
Lrriq1Q0P5X1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Lrriq1Q0P5X1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC46.3■■■■■ 5
Lrriq1Q0P5X1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Lrriq1Q0P5X1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
Lrriq1Q0P5X1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
Lrriq1Q0P5X1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Lrriq1Q0P5X1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
Lrriq1Q0P5X1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC46.12■■■■■ 4.97
Lrriq1Q0P5X1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Lrriq1Q0P5X1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Lrriq1Q0P5X1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Lrriq1Q0P5X1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Lrriq1Q0P5X1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.94■■■■■ 4.94
Lrriq1Q0P5X1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Lrriq1Q0P5X1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Lrriq1Q0P5X1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Lrriq1Q0P5X1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC45.82■■■■■ 4.93
Lrriq1Q0P5X1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Lrriq1Q0P5X1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.82■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
Lrriq1Q0P5X1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Lrriq1Q0P5X1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC45.69■■■■■ 4.91
Lrriq1Q0P5X1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Lrriq1Q0P5X1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Lrriq1Q0P5X1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms