Protein–RNA interactions for Protein: Q07230

Zscan2, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan2Q07230 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Zscan2Q07230 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Zscan2Q07230 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Zscan2Q07230 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Zscan2Q07230 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Zscan2Q07230 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Zscan2Q07230 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Zscan2Q07230 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Zscan2Q07230 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Zscan2Q07230 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Zscan2Q07230 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Zscan2Q07230 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Zscan2Q07230 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Zscan2Q07230 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Zscan2Q07230 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Zscan2Q07230 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Zscan2Q07230 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Zscan2Q07230 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Zscan2Q07230 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Zscan2Q07230 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Zscan2Q07230 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Zscan2Q07230 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Zscan2Q07230 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Zscan2Q07230 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Zscan2Q07230 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Zscan2Q07230 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Zscan2Q07230 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Zscan2Q07230 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Zscan2Q07230 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Zscan2Q07230 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Zscan2Q07230 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Zscan2Q07230 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Zscan2Q07230 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Zscan2Q07230 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Zscan2Q07230 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Zscan2Q07230 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Zscan2Q07230 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Zscan2Q07230 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Zscan2Q07230 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Zscan2Q07230 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Zscan2Q07230 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Zscan2Q07230 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Zscan2Q07230 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Zscan2Q07230 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Zscan2Q07230 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Zscan2Q07230 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Zscan2Q07230 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Zscan2Q07230 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Zscan2Q07230 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Zscan2Q07230 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Zscan2Q07230 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Zscan2Q07230 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Zscan2Q07230 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Zscan2Q07230 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zscan2Q07230 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zscan2Q07230 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zscan2Q07230 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Zscan2Q07230 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zscan2Q07230 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zscan2Q07230 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zscan2Q07230 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Zscan2Q07230 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zscan2Q07230 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Zscan2Q07230 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zscan2Q07230 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zscan2Q07230 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Zscan2Q07230 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zscan2Q07230 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zscan2Q07230 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Zscan2Q07230 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Zscan2Q07230 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Zscan2Q07230 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zscan2Q07230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zscan2Q07230 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zscan2Q07230 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zscan2Q07230 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zscan2Q07230 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zscan2Q07230 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zscan2Q07230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zscan2Q07230 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zscan2Q07230 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zscan2Q07230 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zscan2Q07230 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zscan2Q07230 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zscan2Q07230 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zscan2Q07230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zscan2Q07230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zscan2Q07230 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zscan2Q07230 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zscan2Q07230 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zscan2Q07230 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zscan2Q07230 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Zscan2Q07230 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zscan2Q07230 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zscan2Q07230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms