Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SryQ05738 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SryQ05738 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SryQ05738 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SryQ05738 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SryQ05738 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SryQ05738 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SryQ05738 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SryQ05738 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SryQ05738 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SryQ05738 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SryQ05738 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SryQ05738 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SryQ05738 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SryQ05738 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SryQ05738 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SryQ05738 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SryQ05738 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SryQ05738 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SryQ05738 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SryQ05738 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SryQ05738 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SryQ05738 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SryQ05738 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SryQ05738 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SryQ05738 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SryQ05738 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SryQ05738 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SryQ05738 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SryQ05738 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SryQ05738 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SryQ05738 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SryQ05738 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SryQ05738 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SryQ05738 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SryQ05738 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SryQ05738 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SryQ05738 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SryQ05738 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SryQ05738 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SryQ05738 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SryQ05738 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SryQ05738 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SryQ05738 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SryQ05738 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SryQ05738 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SryQ05738 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SryQ05738 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SryQ05738 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SryQ05738 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SryQ05738 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SryQ05738 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SryQ05738 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SryQ05738 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SryQ05738 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SryQ05738 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SryQ05738 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SryQ05738 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SryQ05738 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SryQ05738 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SryQ05738 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SryQ05738 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SryQ05738 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SryQ05738 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SryQ05738 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SryQ05738 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SryQ05738 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SryQ05738 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SryQ05738 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SryQ05738 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SryQ05738 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SryQ05738 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SryQ05738 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SryQ05738 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SryQ05738 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SryQ05738 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SryQ05738 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SryQ05738 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SryQ05738 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SryQ05738 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SryQ05738 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SryQ05738 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SryQ05738 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SryQ05738 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SryQ05738 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SryQ05738 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SryQ05738 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SryQ05738 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SryQ05738 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SryQ05738 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SryQ05738 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SryQ05738 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SryQ05738 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SryQ05738 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SryQ05738 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SryQ05738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SryQ05738 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SryQ05738 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SryQ05738 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SryQ05738 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms