Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Mmp11Q02853 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mmp11Q02853 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Mmp11Q02853 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Mmp11Q02853 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mmp11Q02853 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Mmp11Q02853 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Mmp11Q02853 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Mmp11Q02853 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mmp11Q02853 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Mmp11Q02853 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Mmp11Q02853 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Mmp11Q02853 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Mmp11Q02853 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mmp11Q02853 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Mmp11Q02853 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Mmp11Q02853 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Mmp11Q02853 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Mmp11Q02853 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mmp11Q02853 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mmp11Q02853 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mmp11Q02853 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Mmp11Q02853 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mmp11Q02853 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Mmp11Q02853 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Mmp11Q02853 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mmp11Q02853 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Mmp11Q02853 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mmp11Q02853 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Mmp11Q02853 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mmp11Q02853 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mmp11Q02853 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mmp11Q02853 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mmp11Q02853 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mmp11Q02853 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mmp11Q02853 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Mmp11Q02853 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mmp11Q02853 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mmp11Q02853 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mmp11Q02853 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mmp11Q02853 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mmp11Q02853 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mmp11Q02853 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mmp11Q02853 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mmp11Q02853 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mmp11Q02853 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mmp11Q02853 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mmp11Q02853 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mmp11Q02853 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mmp11Q02853 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mmp11Q02853 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mmp11Q02853 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mmp11Q02853 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mmp11Q02853 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mmp11Q02853 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Mmp11Q02853 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mmp11Q02853 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mmp11Q02853 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mmp11Q02853 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mmp11Q02853 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mmp11Q02853 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mmp11Q02853 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mmp11Q02853 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mmp11Q02853 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mmp11Q02853 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mmp11Q02853 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Mmp11Q02853 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp11Q02853 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp11Q02853 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mmp11Q02853 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Mmp11Q02853 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mmp11Q02853 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp11Q02853 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp11Q02853 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mmp11Q02853 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mmp11Q02853 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp11Q02853 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp11Q02853 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp11Q02853 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp11Q02853 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mmp11Q02853 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mmp11Q02853 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mmp11Q02853 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mmp11Q02853 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mmp11Q02853 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mmp11Q02853 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mmp11Q02853 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mmp11Q02853 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mmp11Q02853 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mmp11Q02853 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms