Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Gfi1P70338 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gfi1P70338 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gfi1P70338 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gfi1P70338 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Gfi1P70338 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gfi1P70338 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Gfi1P70338 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Gfi1P70338 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gfi1P70338 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gfi1P70338 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gfi1P70338 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Gfi1P70338 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Gfi1P70338 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gfi1P70338 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gfi1P70338 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gfi1P70338 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gfi1P70338 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gfi1P70338 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gfi1P70338 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gfi1P70338 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gfi1P70338 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gfi1P70338 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gfi1P70338 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gfi1P70338 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gfi1P70338 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gfi1P70338 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gfi1P70338 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gfi1P70338 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gfi1P70338 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gfi1P70338 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gfi1P70338 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gfi1P70338 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gfi1P70338 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gfi1P70338 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gfi1P70338 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gfi1P70338 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gfi1P70338 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gfi1P70338 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gfi1P70338 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Gfi1P70338 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gfi1P70338 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gfi1P70338 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gfi1P70338 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfi1P70338 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gfi1P70338 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gfi1P70338 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gfi1P70338 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gfi1P70338 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gfi1P70338 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gfi1P70338 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gfi1P70338 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gfi1P70338 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gfi1P70338 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gfi1P70338 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gfi1P70338 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gfi1P70338 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gfi1P70338 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gfi1P70338 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gfi1P70338 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gfi1P70338 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gfi1P70338 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gfi1P70338 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gfi1P70338 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gfi1P70338 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gfi1P70338 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gfi1P70338 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gfi1P70338 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gfi1P70338 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gfi1P70338 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gfi1P70338 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gfi1P70338 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gfi1P70338 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gfi1P70338 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gfi1P70338 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gfi1P70338 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gfi1P70338 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gfi1P70338 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gfi1P70338 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gfi1P70338 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gfi1P70338 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gfi1P70338 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gfi1P70338 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gfi1P70338 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gfi1P70338 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gfi1P70338 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gfi1P70338 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gfi1P70338 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gfi1P70338 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms