Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NficP70255 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NficP70255 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NficP70255 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NficP70255 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NficP70255 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NficP70255 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NficP70255 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NficP70255 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NficP70255 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NficP70255 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NficP70255 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NficP70255 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NficP70255 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NficP70255 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NficP70255 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NficP70255 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NficP70255 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NficP70255 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NficP70255 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NficP70255 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NficP70255 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NficP70255 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NficP70255 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NficP70255 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NficP70255 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NficP70255 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NficP70255 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NficP70255 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NficP70255 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NficP70255 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NficP70255 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NficP70255 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NficP70255 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NficP70255 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NficP70255 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NficP70255 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NficP70255 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NficP70255 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NficP70255 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NficP70255 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NficP70255 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NficP70255 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NficP70255 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NficP70255 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NficP70255 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NficP70255 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NficP70255 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NficP70255 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NficP70255 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NficP70255 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NficP70255 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NficP70255 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NficP70255 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NficP70255 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NficP70255 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NficP70255 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NficP70255 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NficP70255 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NficP70255 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NficP70255 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NficP70255 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NficP70255 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NficP70255 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NficP70255 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NficP70255 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NficP70255 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NficP70255 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NficP70255 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NficP70255 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NficP70255 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NficP70255 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NficP70255 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NficP70255 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NficP70255 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NficP70255 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NficP70255 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NficP70255 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NficP70255 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NficP70255 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NficP70255 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NficP70255 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NficP70255 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NficP70255 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NficP70255 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NficP70255 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NficP70255 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NficP70255 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NficP70255 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NficP70255 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NficP70255 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NficP70255 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NficP70255 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NficP70255 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NficP70255 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NficP70255 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NficP70255 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NficP70255 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NficP70255 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NficP70255 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms