Protein–RNA interactions for Protein: P63321

Rala, Ras-related protein Ral-A, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RalaP63321 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
RalaP63321 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RalaP63321 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RalaP63321 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RalaP63321 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RalaP63321 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RalaP63321 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RalaP63321 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RalaP63321 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RalaP63321 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RalaP63321 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RalaP63321 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RalaP63321 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RalaP63321 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RalaP63321 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RalaP63321 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RalaP63321 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RalaP63321 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RalaP63321 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RalaP63321 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
RalaP63321 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RalaP63321 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RalaP63321 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RalaP63321 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RalaP63321 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RalaP63321 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RalaP63321 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RalaP63321 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RalaP63321 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RalaP63321 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RalaP63321 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RalaP63321 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RalaP63321 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
RalaP63321 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RalaP63321 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
RalaP63321 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RalaP63321 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RalaP63321 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RalaP63321 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RalaP63321 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RalaP63321 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RalaP63321 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RalaP63321 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RalaP63321 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RalaP63321 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RalaP63321 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RalaP63321 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RalaP63321 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RalaP63321 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RalaP63321 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RalaP63321 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RalaP63321 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RalaP63321 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RalaP63321 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RalaP63321 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RalaP63321 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RalaP63321 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RalaP63321 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RalaP63321 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RalaP63321 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RalaP63321 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RalaP63321 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RalaP63321 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RalaP63321 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RalaP63321 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RalaP63321 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RalaP63321 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RalaP63321 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RalaP63321 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RalaP63321 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RalaP63321 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RalaP63321 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RalaP63321 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RalaP63321 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RalaP63321 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RalaP63321 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RalaP63321 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RalaP63321 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RalaP63321 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RalaP63321 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RalaP63321 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RalaP63321 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RalaP63321 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RalaP63321 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RalaP63321 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RalaP63321 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RalaP63321 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RalaP63321 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RalaP63321 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RalaP63321 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RalaP63321 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RalaP63321 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RalaP63321 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RalaP63321 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RalaP63321 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RalaP63321 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RalaP63321 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RalaP63321 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RalaP63321 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RalaP63321 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms