Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CartptP56388 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CartptP56388 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CartptP56388 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CartptP56388 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CartptP56388 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CartptP56388 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CartptP56388 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CartptP56388 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CartptP56388 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CartptP56388 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CartptP56388 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CartptP56388 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CartptP56388 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CartptP56388 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CartptP56388 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CartptP56388 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CartptP56388 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CartptP56388 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CartptP56388 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CartptP56388 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CartptP56388 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CartptP56388 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CartptP56388 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CartptP56388 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CartptP56388 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CartptP56388 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CartptP56388 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CartptP56388 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CartptP56388 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CartptP56388 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CartptP56388 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CartptP56388 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CartptP56388 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CartptP56388 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CartptP56388 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CartptP56388 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CartptP56388 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CartptP56388 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CartptP56388 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CartptP56388 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CartptP56388 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CartptP56388 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CartptP56388 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CartptP56388 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CartptP56388 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CartptP56388 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CartptP56388 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CartptP56388 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CartptP56388 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CartptP56388 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CartptP56388 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CartptP56388 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CartptP56388 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CartptP56388 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CartptP56388 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CartptP56388 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CartptP56388 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CartptP56388 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CartptP56388 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CartptP56388 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CartptP56388 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CartptP56388 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CartptP56388 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CartptP56388 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CartptP56388 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CartptP56388 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CartptP56388 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CartptP56388 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CartptP56388 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CartptP56388 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CartptP56388 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CartptP56388 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CartptP56388 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CartptP56388 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CartptP56388 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CartptP56388 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CartptP56388 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CartptP56388 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CartptP56388 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CartptP56388 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CartptP56388 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CartptP56388 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CartptP56388 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CartptP56388 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CartptP56388 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CartptP56388 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CartptP56388 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CartptP56388 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CartptP56388 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CartptP56388 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CartptP56388 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CartptP56388 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CartptP56388 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CartptP56388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CartptP56388 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CartptP56388 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CartptP56388 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CartptP56388 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CartptP56388 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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