Protein–RNA interactions for Protein: P52293

Kpna2, Importin subunit alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna2P52293 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Kpna2P52293 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kpna2P52293 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kpna2P52293 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kpna2P52293 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kpna2P52293 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kpna2P52293 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Kpna2P52293 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Kpna2P52293 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Kpna2P52293 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kpna2P52293 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Kpna2P52293 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kpna2P52293 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Kpna2P52293 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Kpna2P52293 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Kpna2P52293 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Kpna2P52293 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Kpna2P52293 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Kpna2P52293 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Kpna2P52293 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Kpna2P52293 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kpna2P52293 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Kpna2P52293 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Kpna2P52293 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Kpna2P52293 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kpna2P52293 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kpna2P52293 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Kpna2P52293 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kpna2P52293 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Kpna2P52293 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Kpna2P52293 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Kpna2P52293 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kpna2P52293 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kpna2P52293 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kpna2P52293 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kpna2P52293 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kpna2P52293 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kpna2P52293 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kpna2P52293 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kpna2P52293 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kpna2P52293 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kpna2P52293 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Kpna2P52293 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kpna2P52293 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kpna2P52293 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kpna2P52293 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kpna2P52293 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kpna2P52293 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kpna2P52293 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kpna2P52293 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kpna2P52293 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kpna2P52293 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kpna2P52293 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kpna2P52293 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kpna2P52293 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kpna2P52293 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kpna2P52293 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kpna2P52293 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kpna2P52293 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kpna2P52293 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kpna2P52293 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kpna2P52293 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Kpna2P52293 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kpna2P52293 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kpna2P52293 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kpna2P52293 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kpna2P52293 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kpna2P52293 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kpna2P52293 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kpna2P52293 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kpna2P52293 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kpna2P52293 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Kpna2P52293 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kpna2P52293 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Kpna2P52293 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kpna2P52293 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Kpna2P52293 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kpna2P52293 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kpna2P52293 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kpna2P52293 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kpna2P52293 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kpna2P52293 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kpna2P52293 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kpna2P52293 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kpna2P52293 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kpna2P52293 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kpna2P52293 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kpna2P52293 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kpna2P52293 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kpna2P52293 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kpna2P52293 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kpna2P52293 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kpna2P52293 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kpna2P52293 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kpna2P52293 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kpna2P52293 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kpna2P52293 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kpna2P52293 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kpna2P52293 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kpna2P52293 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms