Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Wnt11P48615 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Wnt11P48615 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Wnt11P48615 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Wnt11P48615 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Wnt11P48615 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Wnt11P48615 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Wnt11P48615 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Wnt11P48615 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Wnt11P48615 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Wnt11P48615 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Wnt11P48615 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Wnt11P48615 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Wnt11P48615 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Wnt11P48615 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Wnt11P48615 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Wnt11P48615 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Wnt11P48615 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wnt11P48615 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wnt11P48615 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wnt11P48615 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wnt11P48615 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wnt11P48615 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wnt11P48615 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wnt11P48615 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wnt11P48615 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wnt11P48615 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wnt11P48615 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wnt11P48615 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Wnt11P48615 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Wnt11P48615 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Wnt11P48615 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Wnt11P48615 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wnt11P48615 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Wnt11P48615 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wnt11P48615 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Wnt11P48615 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Wnt11P48615 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Wnt11P48615 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Wnt11P48615 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Wnt11P48615 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wnt11P48615 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Wnt11P48615 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Wnt11P48615 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Wnt11P48615 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wnt11P48615 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Wnt11P48615 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wnt11P48615 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Wnt11P48615 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wnt11P48615 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wnt11P48615 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wnt11P48615 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wnt11P48615 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wnt11P48615 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wnt11P48615 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Wnt11P48615 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Wnt11P48615 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wnt11P48615 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Wnt11P48615 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Wnt11P48615 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wnt11P48615 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Wnt11P48615 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Wnt11P48615 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Wnt11P48615 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Wnt11P48615 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Wnt11P48615 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wnt11P48615 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wnt11P48615 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Wnt11P48615 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Wnt11P48615 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Wnt11P48615 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Wnt11P48615 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Wnt11P48615 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wnt11P48615 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wnt11P48615 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Wnt11P48615 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Wnt11P48615 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Wnt11P48615 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Wnt11P48615 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wnt11P48615 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wnt11P48615 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Wnt11P48615 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Wnt11P48615 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Wnt11P48615 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Wnt11P48615 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Wnt11P48615 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wnt11P48615 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wnt11P48615 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Wnt11P48615 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Wnt11P48615 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wnt11P48615 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wnt11P48615 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wnt11P48615 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wnt11P48615 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wnt11P48615 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wnt11P48615 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wnt11P48615 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Wnt11P48615 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wnt11P48615 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Wnt11P48615 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms