Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Nkx2-2P42586 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nkx2-2P42586 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nkx2-2P42586 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nkx2-2P42586 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nkx2-2P42586 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nkx2-2P42586 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Nkx2-2P42586 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx2-2P42586 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx2-2P42586 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx2-2P42586 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx2-2P42586 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx2-2P42586 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx2-2P42586 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx2-2P42586 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nkx2-2P42586 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-2P42586 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-2P42586 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx2-2P42586 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-2P42586 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx2-2P42586 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-2P42586 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-2P42586 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nkx2-2P42586 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-2P42586 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nkx2-2P42586 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nkx2-2P42586 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-2P42586 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-2P42586 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nkx2-2P42586 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx2-2P42586 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx2-2P42586 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-2P42586 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nkx2-2P42586 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nkx2-2P42586 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nkx2-2P42586 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nkx2-2P42586 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nkx2-2P42586 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx2-2P42586 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nkx2-2P42586 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx2-2P42586 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx2-2P42586 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nkx2-2P42586 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx2-2P42586 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nkx2-2P42586 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nkx2-2P42586 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nkx2-2P42586 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nkx2-2P42586 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nkx2-2P42586 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nkx2-2P42586 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx2-2P42586 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx2-2P42586 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx2-2P42586 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx2-2P42586 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx2-2P42586 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx2-2P42586 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-2P42586 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-2P42586 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx2-2P42586 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx2-2P42586 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx2-2P42586 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx2-2P42586 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-2P42586 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-2P42586 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx2-2P42586 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx2-2P42586 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx2-2P42586 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx2-2P42586 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx2-2P42586 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-2P42586 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nkx2-2P42586 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-2P42586 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-2P42586 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-2P42586 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-2P42586 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-2P42586 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx2-2P42586 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx2-2P42586 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx2-2P42586 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nkx2-2P42586 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx2-2P42586 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nkx2-2P42586 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx2-2P42586 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nkx2-2P42586 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx2-2P42586 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nkx2-2P42586 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-2P42586 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-2P42586 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nkx2-2P42586 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms