Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Thbs1P35441 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Thbs1P35441 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Thbs1P35441 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Thbs1P35441 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Thbs1P35441 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thbs1P35441 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Thbs1P35441 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Thbs1P35441 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Thbs1P35441 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Thbs1P35441 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Thbs1P35441 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Thbs1P35441 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Thbs1P35441 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Thbs1P35441 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Thbs1P35441 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Thbs1P35441 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Thbs1P35441 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Thbs1P35441 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thbs1P35441 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Thbs1P35441 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Thbs1P35441 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thbs1P35441 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thbs1P35441 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Thbs1P35441 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thbs1P35441 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thbs1P35441 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Thbs1P35441 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Thbs1P35441 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thbs1P35441 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Thbs1P35441 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thbs1P35441 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thbs1P35441 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Thbs1P35441 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Thbs1P35441 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Thbs1P35441 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Thbs1P35441 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Thbs1P35441 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Thbs1P35441 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Thbs1P35441 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Thbs1P35441 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Thbs1P35441 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Thbs1P35441 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Thbs1P35441 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thbs1P35441 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Thbs1P35441 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Thbs1P35441 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Thbs1P35441 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Thbs1P35441 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Thbs1P35441 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Thbs1P35441 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thbs1P35441 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thbs1P35441 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Thbs1P35441 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Thbs1P35441 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Thbs1P35441 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Thbs1P35441 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Thbs1P35441 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Thbs1P35441 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Thbs1P35441 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Thbs1P35441 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Thbs1P35441 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Thbs1P35441 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Thbs1P35441 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Thbs1P35441 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Thbs1P35441 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Thbs1P35441 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Thbs1P35441 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Thbs1P35441 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Thbs1P35441 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Thbs1P35441 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Thbs1P35441 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Thbs1P35441 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Thbs1P35441 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Thbs1P35441 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Thbs1P35441 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thbs1P35441 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Thbs1P35441 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Thbs1P35441 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Thbs1P35441 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Thbs1P35441 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Thbs1P35441 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Thbs1P35441 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Thbs1P35441 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thbs1P35441 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Thbs1P35441 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Thbs1P35441 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Thbs1P35441 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Thbs1P35441 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms