Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Hoxc5P32043 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxc5P32043 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Hoxc5P32043 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hoxc5P32043 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxc5P32043 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Hoxc5P32043 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxc5P32043 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Hoxc5P32043 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxc5P32043 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxc5P32043 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc5P32043 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hoxc5P32043 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc5P32043 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxc5P32043 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxc5P32043 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Hoxc5P32043 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxc5P32043 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hoxc5P32043 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxc5P32043 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hoxc5P32043 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxc5P32043 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxc5P32043 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxc5P32043 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxc5P32043 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxc5P32043 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc5P32043 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc5P32043 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc5P32043 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc5P32043 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc5P32043 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc5P32043 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxc5P32043 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc5P32043 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc5P32043 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc5P32043 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc5P32043 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxc5P32043 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc5P32043 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc5P32043 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc5P32043 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxc5P32043 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc5P32043 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc5P32043 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc5P32043 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Hoxc5P32043 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc5P32043 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc5P32043 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc5P32043 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc5P32043 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc5P32043 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxc5P32043 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxc5P32043 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxc5P32043 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxc5P32043 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxc5P32043 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxc5P32043 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxc5P32043 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc5P32043 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxc5P32043 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hoxc5P32043 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxc5P32043 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxc5P32043 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxc5P32043 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxc5P32043 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxc5P32043 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxc5P32043 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxc5P32043 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxc5P32043 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxc5P32043 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxc5P32043 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxc5P32043 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxc5P32043 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxc5P32043 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxc5P32043 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc5P32043 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc5P32043 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hoxc5P32043 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxc5P32043 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxc5P32043 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxc5P32043 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxc5P32043 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc5P32043 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc5P32043 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc5P32043 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc5P32043 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc5P32043 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc5P32043 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc5P32043 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc5P32043 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc5P32043 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc5P32043 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc5P32043 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxc5P32043 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc5P32043 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms