Protein–RNA interactions for Protein: P23780

Glb1, Beta-galactosidase, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glb1P23780 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Glb1P23780 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Glb1P23780 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Glb1P23780 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Glb1P23780 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Glb1P23780 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Glb1P23780 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Glb1P23780 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Glb1P23780 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Glb1P23780 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Glb1P23780 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Glb1P23780 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Glb1P23780 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Glb1P23780 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Glb1P23780 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Glb1P23780 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Glb1P23780 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Glb1P23780 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Glb1P23780 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Glb1P23780 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Glb1P23780 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Glb1P23780 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Glb1P23780 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Glb1P23780 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Glb1P23780 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Glb1P23780 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Glb1P23780 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Glb1P23780 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Glb1P23780 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Glb1P23780 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Glb1P23780 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Glb1P23780 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Glb1P23780 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Glb1P23780 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Glb1P23780 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Glb1P23780 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Glb1P23780 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Glb1P23780 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Glb1P23780 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Glb1P23780 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Glb1P23780 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Glb1P23780 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Glb1P23780 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Glb1P23780 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Glb1P23780 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Glb1P23780 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Glb1P23780 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Glb1P23780 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Glb1P23780 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Glb1P23780 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Glb1P23780 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Glb1P23780 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Glb1P23780 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Glb1P23780 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Glb1P23780 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Glb1P23780 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Glb1P23780 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Glb1P23780 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Glb1P23780 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Glb1P23780 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Glb1P23780 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Glb1P23780 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Glb1P23780 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Glb1P23780 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Glb1P23780 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Glb1P23780 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Glb1P23780 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Glb1P23780 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Glb1P23780 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Glb1P23780 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Glb1P23780 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Glb1P23780 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Glb1P23780 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Glb1P23780 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Glb1P23780 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Glb1P23780 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Glb1P23780 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Glb1P23780 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Glb1P23780 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Glb1P23780 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Glb1P23780 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Glb1P23780 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glb1P23780 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glb1P23780 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Glb1P23780 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Glb1P23780 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Glb1P23780 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Glb1P23780 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Glb1P23780 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Glb1P23780 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Glb1P23780 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Glb1P23780 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Glb1P23780 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Glb1P23780 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms