Protein–RNA interactions for Protein: P18760

Cfl1, Cofilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfl1P18760 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cfl1P18760 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cfl1P18760 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cfl1P18760 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cfl1P18760 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cfl1P18760 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cfl1P18760 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cfl1P18760 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cfl1P18760 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cfl1P18760 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfl1P18760 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfl1P18760 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfl1P18760 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cfl1P18760 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cfl1P18760 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cfl1P18760 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cfl1P18760 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cfl1P18760 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cfl1P18760 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cfl1P18760 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfl1P18760 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cfl1P18760 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cfl1P18760 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfl1P18760 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfl1P18760 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cfl1P18760 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfl1P18760 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cfl1P18760 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfl1P18760 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfl1P18760 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfl1P18760 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfl1P18760 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfl1P18760 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfl1P18760 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfl1P18760 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cfl1P18760 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cfl1P18760 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfl1P18760 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfl1P18760 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfl1P18760 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfl1P18760 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfl1P18760 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfl1P18760 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfl1P18760 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfl1P18760 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cfl1P18760 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cfl1P18760 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cfl1P18760 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cfl1P18760 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cfl1P18760 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cfl1P18760 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cfl1P18760 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cfl1P18760 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cfl1P18760 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cfl1P18760 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cfl1P18760 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cfl1P18760 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cfl1P18760 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cfl1P18760 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cfl1P18760 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfl1P18760 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfl1P18760 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfl1P18760 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfl1P18760 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfl1P18760 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfl1P18760 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfl1P18760 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfl1P18760 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfl1P18760 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfl1P18760 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfl1P18760 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfl1P18760 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfl1P18760 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfl1P18760 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cfl1P18760 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cfl1P18760 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cfl1P18760 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cfl1P18760 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cfl1P18760 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfl1P18760 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cfl1P18760 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cfl1P18760 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cfl1P18760 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfl1P18760 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cfl1P18760 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfl1P18760 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfl1P18760 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfl1P18760 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfl1P18760 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfl1P18760 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfl1P18760 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfl1P18760 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfl1P18760 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfl1P18760 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cfl1P18760 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cfl1P18760 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cfl1P18760 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cfl1P18760 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cfl1P18760 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cfl1P18760 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms