Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
P18533 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
P18533 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
P18533 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
P18533 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
P18533 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
P18533 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
P18533 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
P18533 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
P18533 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
P18533 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
P18533 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
P18533 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
P18533 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
P18533 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
P18533 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
P18533 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
P18533 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
P18533 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P18533 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P18533 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P18533 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
P18533 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
P18533 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
P18533 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
P18533 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
P18533 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
P18533 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
P18533 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
P18533 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
P18533 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
P18533 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
P18533 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
P18533 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
P18533 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
P18533 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
P18533 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
P18533 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
P18533 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
P18533 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
P18533 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
P18533 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
P18533 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
P18533 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
P18533 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P18533 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P18533 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P18533 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
P18533 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
P18533 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
P18533 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
P18533 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
P18533 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
P18533 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
P18533 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
P18533 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P18533 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
P18533 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P18533 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P18533 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
P18533 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P18533 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P18533 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P18533 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P18533 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P18533 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
P18533 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
P18533 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
P18533 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.54■■■□□ 2
P18533 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P18533 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
P18533 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P18533 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
P18533 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P18533 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P18533 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
P18533 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
P18533 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
P18533 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
P18533 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
P18533 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P18533 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P18533 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
P18533 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
P18533 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P18533 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
P18533 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P18533 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
P18533 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
P18533 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P18533 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
P18533 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
P18533 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
P18533 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P18533 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
P18533 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
P18533 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P18533 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P18533 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
P18533 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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