Protein–RNA interactions for Protein: P09813

Apoa2, Apolipoprotein A-II, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa2P09813 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Apoa2P09813 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Apoa2P09813 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Apoa2P09813 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Apoa2P09813 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Apoa2P09813 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Apoa2P09813 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Apoa2P09813 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Apoa2P09813 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apoa2P09813 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Apoa2P09813 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Apoa2P09813 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Apoa2P09813 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Apoa2P09813 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Apoa2P09813 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Apoa2P09813 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Apoa2P09813 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Apoa2P09813 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Apoa2P09813 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Apoa2P09813 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Apoa2P09813 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apoa2P09813 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apoa2P09813 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apoa2P09813 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apoa2P09813 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Apoa2P09813 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Apoa2P09813 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apoa2P09813 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apoa2P09813 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apoa2P09813 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apoa2P09813 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Apoa2P09813 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apoa2P09813 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apoa2P09813 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apoa2P09813 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apoa2P09813 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apoa2P09813 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apoa2P09813 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apoa2P09813 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apoa2P09813 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apoa2P09813 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apoa2P09813 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apoa2P09813 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apoa2P09813 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Apoa2P09813 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Apoa2P09813 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apoa2P09813 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apoa2P09813 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apoa2P09813 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apoa2P09813 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apoa2P09813 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apoa2P09813 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apoa2P09813 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apoa2P09813 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Apoa2P09813 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apoa2P09813 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apoa2P09813 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apoa2P09813 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apoa2P09813 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apoa2P09813 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apoa2P09813 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Apoa2P09813 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apoa2P09813 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apoa2P09813 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apoa2P09813 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apoa2P09813 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apoa2P09813 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apoa2P09813 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apoa2P09813 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apoa2P09813 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apoa2P09813 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apoa2P09813 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apoa2P09813 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Apoa2P09813 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apoa2P09813 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apoa2P09813 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoa2P09813 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoa2P09813 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apoa2P09813 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apoa2P09813 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apoa2P09813 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apoa2P09813 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apoa2P09813 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apoa2P09813 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apoa2P09813 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apoa2P09813 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apoa2P09813 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apoa2P09813 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apoa2P09813 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms