Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SgceO70258 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SgceO70258 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SgceO70258 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SgceO70258 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SgceO70258 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SgceO70258 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SgceO70258 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SgceO70258 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SgceO70258 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SgceO70258 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SgceO70258 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SgceO70258 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SgceO70258 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SgceO70258 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SgceO70258 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SgceO70258 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SgceO70258 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SgceO70258 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SgceO70258 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SgceO70258 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SgceO70258 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SgceO70258 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SgceO70258 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SgceO70258 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SgceO70258 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SgceO70258 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SgceO70258 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SgceO70258 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SgceO70258 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SgceO70258 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SgceO70258 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SgceO70258 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SgceO70258 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SgceO70258 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SgceO70258 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SgceO70258 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SgceO70258 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SgceO70258 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SgceO70258 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SgceO70258 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SgceO70258 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SgceO70258 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SgceO70258 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SgceO70258 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SgceO70258 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SgceO70258 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SgceO70258 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SgceO70258 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SgceO70258 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SgceO70258 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SgceO70258 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SgceO70258 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SgceO70258 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SgceO70258 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SgceO70258 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SgceO70258 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SgceO70258 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SgceO70258 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SgceO70258 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SgceO70258 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SgceO70258 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SgceO70258 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SgceO70258 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SgceO70258 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SgceO70258 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SgceO70258 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SgceO70258 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SgceO70258 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SgceO70258 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SgceO70258 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SgceO70258 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SgceO70258 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SgceO70258 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SgceO70258 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SgceO70258 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SgceO70258 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SgceO70258 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SgceO70258 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SgceO70258 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SgceO70258 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SgceO70258 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SgceO70258 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SgceO70258 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SgceO70258 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SgceO70258 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SgceO70258 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SgceO70258 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SgceO70258 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SgceO70258 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SgceO70258 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SgceO70258 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SgceO70258 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SgceO70258 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SgceO70258 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SgceO70258 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SgceO70258 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SgceO70258 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SgceO70258 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SgceO70258 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms