Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BckdkO55028 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BckdkO55028 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BckdkO55028 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BckdkO55028 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
BckdkO55028 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
BckdkO55028 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BckdkO55028 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BckdkO55028 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BckdkO55028 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BckdkO55028 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BckdkO55028 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BckdkO55028 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BckdkO55028 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BckdkO55028 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BckdkO55028 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BckdkO55028 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BckdkO55028 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BckdkO55028 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BckdkO55028 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BckdkO55028 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BckdkO55028 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BckdkO55028 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BckdkO55028 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BckdkO55028 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BckdkO55028 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
BckdkO55028 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BckdkO55028 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BckdkO55028 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BckdkO55028 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BckdkO55028 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BckdkO55028 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BckdkO55028 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BckdkO55028 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BckdkO55028 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BckdkO55028 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BckdkO55028 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BckdkO55028 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BckdkO55028 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BckdkO55028 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BckdkO55028 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BckdkO55028 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BckdkO55028 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BckdkO55028 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BckdkO55028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BckdkO55028 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BckdkO55028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BckdkO55028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BckdkO55028 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BckdkO55028 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BckdkO55028 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BckdkO55028 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BckdkO55028 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BckdkO55028 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BckdkO55028 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BckdkO55028 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BckdkO55028 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BckdkO55028 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BckdkO55028 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BckdkO55028 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BckdkO55028 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BckdkO55028 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BckdkO55028 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BckdkO55028 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BckdkO55028 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BckdkO55028 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BckdkO55028 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BckdkO55028 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BckdkO55028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BckdkO55028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BckdkO55028 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BckdkO55028 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BckdkO55028 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BckdkO55028 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BckdkO55028 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BckdkO55028 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BckdkO55028 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BckdkO55028 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BckdkO55028 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BckdkO55028 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BckdkO55028 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BckdkO55028 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BckdkO55028 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BckdkO55028 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BckdkO55028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BckdkO55028 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BckdkO55028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BckdkO55028 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BckdkO55028 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BckdkO55028 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BckdkO55028 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BckdkO55028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BckdkO55028 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BckdkO55028 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms