Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Cetn3O35648 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cetn3O35648 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cetn3O35648 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cetn3O35648 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cetn3O35648 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cetn3O35648 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Cetn3O35648 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cetn3O35648 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cetn3O35648 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Cetn3O35648 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cetn3O35648 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cetn3O35648 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Cetn3O35648 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cetn3O35648 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cetn3O35648 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cetn3O35648 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cetn3O35648 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cetn3O35648 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cetn3O35648 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cetn3O35648 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cetn3O35648 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cetn3O35648 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cetn3O35648 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cetn3O35648 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cetn3O35648 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cetn3O35648 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cetn3O35648 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cetn3O35648 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cetn3O35648 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cetn3O35648 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cetn3O35648 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cetn3O35648 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cetn3O35648 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cetn3O35648 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cetn3O35648 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cetn3O35648 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cetn3O35648 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cetn3O35648 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cetn3O35648 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cetn3O35648 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cetn3O35648 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cetn3O35648 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cetn3O35648 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cetn3O35648 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cetn3O35648 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cetn3O35648 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cetn3O35648 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cetn3O35648 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cetn3O35648 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cetn3O35648 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cetn3O35648 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cetn3O35648 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cetn3O35648 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cetn3O35648 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Cetn3O35648 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cetn3O35648 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cetn3O35648 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Cetn3O35648 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cetn3O35648 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Cetn3O35648 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Cetn3O35648 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cetn3O35648 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cetn3O35648 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cetn3O35648 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cetn3O35648 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cetn3O35648 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cetn3O35648 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cetn3O35648 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cetn3O35648 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cetn3O35648 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cetn3O35648 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cetn3O35648 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cetn3O35648 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cetn3O35648 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cetn3O35648 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cetn3O35648 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cetn3O35648 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cetn3O35648 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cetn3O35648 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cetn3O35648 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cetn3O35648 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Cetn3O35648 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cetn3O35648 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cetn3O35648 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cetn3O35648 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cetn3O35648 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cetn3O35648 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cetn3O35648 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cetn3O35648 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cetn3O35648 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cetn3O35648 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cetn3O35648 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cetn3O35648 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms