Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KeraO35367 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KeraO35367 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KeraO35367 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KeraO35367 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KeraO35367 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KeraO35367 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
KeraO35367 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KeraO35367 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KeraO35367 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KeraO35367 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
KeraO35367 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KeraO35367 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KeraO35367 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KeraO35367 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KeraO35367 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KeraO35367 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KeraO35367 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KeraO35367 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KeraO35367 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KeraO35367 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KeraO35367 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KeraO35367 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KeraO35367 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KeraO35367 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KeraO35367 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KeraO35367 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KeraO35367 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KeraO35367 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KeraO35367 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KeraO35367 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KeraO35367 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KeraO35367 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KeraO35367 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KeraO35367 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KeraO35367 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KeraO35367 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KeraO35367 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KeraO35367 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KeraO35367 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KeraO35367 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KeraO35367 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KeraO35367 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KeraO35367 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KeraO35367 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KeraO35367 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KeraO35367 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KeraO35367 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KeraO35367 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KeraO35367 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KeraO35367 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KeraO35367 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KeraO35367 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KeraO35367 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KeraO35367 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KeraO35367 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KeraO35367 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KeraO35367 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KeraO35367 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KeraO35367 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KeraO35367 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KeraO35367 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KeraO35367 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KeraO35367 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KeraO35367 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KeraO35367 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KeraO35367 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KeraO35367 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KeraO35367 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KeraO35367 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KeraO35367 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KeraO35367 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KeraO35367 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KeraO35367 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KeraO35367 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KeraO35367 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KeraO35367 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KeraO35367 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KeraO35367 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KeraO35367 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KeraO35367 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KeraO35367 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KeraO35367 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KeraO35367 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KeraO35367 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KeraO35367 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KeraO35367 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KeraO35367 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KeraO35367 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KeraO35367 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KeraO35367 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KeraO35367 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KeraO35367 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KeraO35367 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KeraO35367 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KeraO35367 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KeraO35367 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KeraO35367 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KeraO35367 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KeraO35367 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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