Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Kif1cO35071 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kif1cO35071 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kif1cO35071 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Kif1cO35071 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Kif1cO35071 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Kif1cO35071 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kif1cO35071 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Kif1cO35071 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Kif1cO35071 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kif1cO35071 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kif1cO35071 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Kif1cO35071 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kif1cO35071 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kif1cO35071 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kif1cO35071 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kif1cO35071 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kif1cO35071 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kif1cO35071 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kif1cO35071 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kif1cO35071 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kif1cO35071 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kif1cO35071 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kif1cO35071 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kif1cO35071 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kif1cO35071 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kif1cO35071 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kif1cO35071 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kif1cO35071 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kif1cO35071 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kif1cO35071 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kif1cO35071 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif1cO35071 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif1cO35071 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kif1cO35071 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kif1cO35071 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kif1cO35071 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Kif1cO35071 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kif1cO35071 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kif1cO35071 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Kif1cO35071 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Kif1cO35071 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kif1cO35071 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kif1cO35071 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kif1cO35071 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif1cO35071 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kif1cO35071 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kif1cO35071 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif1cO35071 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif1cO35071 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif1cO35071 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif1cO35071 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kif1cO35071 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif1cO35071 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kif1cO35071 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kif1cO35071 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kif1cO35071 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif1cO35071 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif1cO35071 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif1cO35071 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kif1cO35071 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif1cO35071 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif1cO35071 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kif1cO35071 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kif1cO35071 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kif1cO35071 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif1cO35071 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif1cO35071 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif1cO35071 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif1cO35071 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif1cO35071 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Kif1cO35071 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kif1cO35071 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif1cO35071 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kif1cO35071 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kif1cO35071 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kif1cO35071 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif1cO35071 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif1cO35071 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kif1cO35071 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kif1cO35071 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kif1cO35071 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif1cO35071 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif1cO35071 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kif1cO35071 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Kif1cO35071 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif1cO35071 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif1cO35071 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kif1cO35071 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kif1cO35071 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif1cO35071 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif1cO35071 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kif1cO35071 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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