Protein–RNA interactions for Protein: O08524

Tectb, Beta-tectorin, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TectbO08524 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TectbO08524 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TectbO08524 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TectbO08524 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TectbO08524 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TectbO08524 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TectbO08524 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TectbO08524 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TectbO08524 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TectbO08524 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TectbO08524 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TectbO08524 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TectbO08524 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TectbO08524 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TectbO08524 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TectbO08524 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TectbO08524 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TectbO08524 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TectbO08524 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TectbO08524 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TectbO08524 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TectbO08524 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TectbO08524 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TectbO08524 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TectbO08524 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TectbO08524 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TectbO08524 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TectbO08524 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TectbO08524 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TectbO08524 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TectbO08524 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TectbO08524 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TectbO08524 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TectbO08524 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TectbO08524 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TectbO08524 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TectbO08524 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TectbO08524 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TectbO08524 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TectbO08524 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TectbO08524 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TectbO08524 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TectbO08524 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TectbO08524 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TectbO08524 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TectbO08524 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TectbO08524 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TectbO08524 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TectbO08524 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TectbO08524 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TectbO08524 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TectbO08524 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TectbO08524 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TectbO08524 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TectbO08524 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TectbO08524 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TectbO08524 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TectbO08524 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TectbO08524 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TectbO08524 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TectbO08524 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TectbO08524 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TectbO08524 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TectbO08524 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TectbO08524 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TectbO08524 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TectbO08524 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TectbO08524 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TectbO08524 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TectbO08524 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TectbO08524 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TectbO08524 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TectbO08524 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TectbO08524 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TectbO08524 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TectbO08524 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TectbO08524 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TectbO08524 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TectbO08524 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TectbO08524 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TectbO08524 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TectbO08524 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TectbO08524 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TectbO08524 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TectbO08524 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TectbO08524 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TectbO08524 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TectbO08524 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TectbO08524 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TectbO08524 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TectbO08524 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TectbO08524 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TectbO08524 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TectbO08524 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TectbO08524 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TectbO08524 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TectbO08524 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TectbO08524 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TectbO08524 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TectbO08524 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms