Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Gm4141K9J7H2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gm4141K9J7H2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gm4141K9J7H2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm4141K9J7H2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gm4141K9J7H2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gm4141K9J7H2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Gm4141K9J7H2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Gm4141K9J7H2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gm4141K9J7H2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gm4141K9J7H2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gm4141K9J7H2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gm4141K9J7H2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gm4141K9J7H2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm4141K9J7H2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gm4141K9J7H2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gm4141K9J7H2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm4141K9J7H2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm4141K9J7H2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm4141K9J7H2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm4141K9J7H2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gm4141K9J7H2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm4141K9J7H2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm4141K9J7H2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gm4141K9J7H2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm4141K9J7H2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm4141K9J7H2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm4141K9J7H2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm4141K9J7H2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gm4141K9J7H2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm4141K9J7H2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm4141K9J7H2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm4141K9J7H2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gm4141K9J7H2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm4141K9J7H2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm4141K9J7H2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm4141K9J7H2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm4141K9J7H2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm4141K9J7H2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gm4141K9J7H2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gm4141K9J7H2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm4141K9J7H2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm4141K9J7H2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm4141K9J7H2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm4141K9J7H2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm4141K9J7H2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm4141K9J7H2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm4141K9J7H2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm4141K9J7H2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm4141K9J7H2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm4141K9J7H2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm4141K9J7H2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm4141K9J7H2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm4141K9J7H2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm4141K9J7H2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm4141K9J7H2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm4141K9J7H2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm4141K9J7H2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm4141K9J7H2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm4141K9J7H2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm4141K9J7H2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm4141K9J7H2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm4141K9J7H2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm4141K9J7H2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm4141K9J7H2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm4141K9J7H2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm4141K9J7H2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm4141K9J7H2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm4141K9J7H2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm4141K9J7H2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm4141K9J7H2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm4141K9J7H2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm4141K9J7H2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm4141K9J7H2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm4141K9J7H2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm4141K9J7H2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm4141K9J7H2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm4141K9J7H2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm4141K9J7H2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm4141K9J7H2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm4141K9J7H2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm4141K9J7H2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm4141K9J7H2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm4141K9J7H2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm4141K9J7H2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm4141K9J7H2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm4141K9J7H2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm4141K9J7H2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm4141K9J7H2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm4141K9J7H2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms