Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc71lE9Q4T4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc71lE9Q4T4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc71lE9Q4T4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc71lE9Q4T4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc71lE9Q4T4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc71lE9Q4T4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc71lE9Q4T4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71lE9Q4T4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc71lE9Q4T4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc71lE9Q4T4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc71lE9Q4T4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc71lE9Q4T4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc71lE9Q4T4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc71lE9Q4T4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc71lE9Q4T4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc71lE9Q4T4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc71lE9Q4T4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71lE9Q4T4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc71lE9Q4T4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71lE9Q4T4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc71lE9Q4T4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71lE9Q4T4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc71lE9Q4T4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71lE9Q4T4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc71lE9Q4T4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc71lE9Q4T4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc71lE9Q4T4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc71lE9Q4T4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc71lE9Q4T4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc71lE9Q4T4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc71lE9Q4T4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc71lE9Q4T4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc71lE9Q4T4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71lE9Q4T4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc71lE9Q4T4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71lE9Q4T4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71lE9Q4T4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71lE9Q4T4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71lE9Q4T4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc71lE9Q4T4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71lE9Q4T4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71lE9Q4T4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71lE9Q4T4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc71lE9Q4T4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71lE9Q4T4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71lE9Q4T4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71lE9Q4T4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms