Protein–RNA interactions for Protein: D3YY49

Lipo2, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo2D3YY49 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Lipo2D3YY49 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lipo2D3YY49 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lipo2D3YY49 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lipo2D3YY49 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Lipo2D3YY49 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lipo2D3YY49 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Lipo2D3YY49 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Lipo2D3YY49 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lipo2D3YY49 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Lipo2D3YY49 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lipo2D3YY49 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Lipo2D3YY49 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lipo2D3YY49 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Lipo2D3YY49 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lipo2D3YY49 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lipo2D3YY49 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lipo2D3YY49 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lipo2D3YY49 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lipo2D3YY49 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lipo2D3YY49 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Lipo2D3YY49 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lipo2D3YY49 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Lipo2D3YY49 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Lipo2D3YY49 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Lipo2D3YY49 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lipo2D3YY49 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Lipo2D3YY49 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Lipo2D3YY49 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lipo2D3YY49 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lipo2D3YY49 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lipo2D3YY49 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lipo2D3YY49 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lipo2D3YY49 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lipo2D3YY49 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Lipo2D3YY49 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lipo2D3YY49 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lipo2D3YY49 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Lipo2D3YY49 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lipo2D3YY49 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lipo2D3YY49 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Lipo2D3YY49 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lipo2D3YY49 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lipo2D3YY49 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lipo2D3YY49 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Lipo2D3YY49 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lipo2D3YY49 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lipo2D3YY49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lipo2D3YY49 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Lipo2D3YY49 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Lipo2D3YY49 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lipo2D3YY49 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lipo2D3YY49 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lipo2D3YY49 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lipo2D3YY49 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lipo2D3YY49 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Lipo2D3YY49 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lipo2D3YY49 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lipo2D3YY49 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lipo2D3YY49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lipo2D3YY49 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lipo2D3YY49 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lipo2D3YY49 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lipo2D3YY49 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lipo2D3YY49 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lipo2D3YY49 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lipo2D3YY49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lipo2D3YY49 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lipo2D3YY49 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lipo2D3YY49 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lipo2D3YY49 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Lipo2D3YY49 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lipo2D3YY49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lipo2D3YY49 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lipo2D3YY49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lipo2D3YY49 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lipo2D3YY49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lipo2D3YY49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lipo2D3YY49 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lipo2D3YY49 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lipo2D3YY49 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lipo2D3YY49 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lipo2D3YY49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lipo2D3YY49 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lipo2D3YY49 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lipo2D3YY49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lipo2D3YY49 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lipo2D3YY49 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lipo2D3YY49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lipo2D3YY49 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lipo2D3YY49 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lipo2D3YY49 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lipo2D3YY49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lipo2D3YY49 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lipo2D3YY49 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lipo2D3YY49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lipo2D3YY49 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lipo2D3YY49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lipo2D3YY49 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lipo2D3YY49 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.5 ms