Protein–RNA interactions for Protein: D3YVV6

Hs3st4, Sulfotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st4D3YVV6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Hs3st4D3YVV6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hs3st4D3YVV6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hs3st4D3YVV6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hs3st4D3YVV6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hs3st4D3YVV6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Hs3st4D3YVV6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Hs3st4D3YVV6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Hs3st4D3YVV6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hs3st4D3YVV6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Hs3st4D3YVV6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hs3st4D3YVV6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hs3st4D3YVV6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Hs3st4D3YVV6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Hs3st4D3YVV6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hs3st4D3YVV6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hs3st4D3YVV6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hs3st4D3YVV6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hs3st4D3YVV6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hs3st4D3YVV6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hs3st4D3YVV6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hs3st4D3YVV6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hs3st4D3YVV6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hs3st4D3YVV6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hs3st4D3YVV6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hs3st4D3YVV6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Hs3st4D3YVV6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hs3st4D3YVV6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hs3st4D3YVV6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hs3st4D3YVV6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hs3st4D3YVV6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hs3st4D3YVV6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hs3st4D3YVV6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hs3st4D3YVV6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hs3st4D3YVV6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hs3st4D3YVV6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hs3st4D3YVV6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hs3st4D3YVV6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hs3st4D3YVV6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hs3st4D3YVV6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hs3st4D3YVV6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Hs3st4D3YVV6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hs3st4D3YVV6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hs3st4D3YVV6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hs3st4D3YVV6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Hs3st4D3YVV6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hs3st4D3YVV6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hs3st4D3YVV6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hs3st4D3YVV6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Hs3st4D3YVV6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hs3st4D3YVV6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hs3st4D3YVV6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hs3st4D3YVV6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hs3st4D3YVV6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hs3st4D3YVV6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hs3st4D3YVV6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hs3st4D3YVV6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hs3st4D3YVV6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hs3st4D3YVV6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hs3st4D3YVV6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hs3st4D3YVV6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hs3st4D3YVV6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hs3st4D3YVV6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hs3st4D3YVV6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hs3st4D3YVV6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hs3st4D3YVV6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hs3st4D3YVV6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hs3st4D3YVV6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hs3st4D3YVV6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hs3st4D3YVV6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hs3st4D3YVV6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hs3st4D3YVV6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hs3st4D3YVV6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hs3st4D3YVV6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hs3st4D3YVV6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hs3st4D3YVV6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hs3st4D3YVV6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hs3st4D3YVV6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hs3st4D3YVV6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hs3st4D3YVV6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hs3st4D3YVV6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hs3st4D3YVV6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hs3st4D3YVV6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hs3st4D3YVV6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hs3st4D3YVV6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hs3st4D3YVV6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hs3st4D3YVV6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hs3st4D3YVV6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hs3st4D3YVV6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hs3st4D3YVV6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hs3st4D3YVV6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hs3st4D3YVV6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hs3st4D3YVV6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hs3st4D3YVV6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hs3st4D3YVV6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms