Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Vmn1r180B9EK86 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vmn1r180B9EK86 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r180B9EK86 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vmn1r180B9EK86 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn1r180B9EK86 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r180B9EK86 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Vmn1r180B9EK86 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn1r180B9EK86 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r180B9EK86 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vmn1r180B9EK86 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r180B9EK86 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r180B9EK86 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r180B9EK86 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r180B9EK86 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r180B9EK86 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vmn1r180B9EK86 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r180B9EK86 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r180B9EK86 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r180B9EK86 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r180B9EK86 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r180B9EK86 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r180B9EK86 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r180B9EK86 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r180B9EK86 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r180B9EK86 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r180B9EK86 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r180B9EK86 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vmn1r180B9EK86 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r180B9EK86 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r180B9EK86 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vmn1r180B9EK86 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vmn1r180B9EK86 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vmn1r180B9EK86 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r180B9EK86 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r180B9EK86 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r180B9EK86 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r180B9EK86 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r180B9EK86 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r180B9EK86 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r180B9EK86 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r180B9EK86 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r180B9EK86 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn1r180B9EK86 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r180B9EK86 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r180B9EK86 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r180B9EK86 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r180B9EK86 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r180B9EK86 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r180B9EK86 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r180B9EK86 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r180B9EK86 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r180B9EK86 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r180B9EK86 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r180B9EK86 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r180B9EK86 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r180B9EK86 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r180B9EK86 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r180B9EK86 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r180B9EK86 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r180B9EK86 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r180B9EK86 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r180B9EK86 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r180B9EK86 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r180B9EK86 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r180B9EK86 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r180B9EK86 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r180B9EK86 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r180B9EK86 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r180B9EK86 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r180B9EK86 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r180B9EK86 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r180B9EK86 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r180B9EK86 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r180B9EK86 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r180B9EK86 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r180B9EK86 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r180B9EK86 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r180B9EK86 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r180B9EK86 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r180B9EK86 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r180B9EK86 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r180B9EK86 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r180B9EK86 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r180B9EK86 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r180B9EK86 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r180B9EK86 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r180B9EK86 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r180B9EK86 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r180B9EK86 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r180B9EK86 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r180B9EK86 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r180B9EK86 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r180B9EK86 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r180B9EK86 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms