Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprsB0V2N1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprsB0V2N1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtprsB0V2N1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprsB0V2N1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprsB0V2N1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprsB0V2N1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PtprsB0V2N1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PtprsB0V2N1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PtprsB0V2N1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprsB0V2N1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprsB0V2N1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprsB0V2N1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprsB0V2N1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PtprsB0V2N1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PtprsB0V2N1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PtprsB0V2N1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PtprsB0V2N1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprsB0V2N1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprsB0V2N1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtprsB0V2N1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprsB0V2N1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprsB0V2N1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprsB0V2N1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprsB0V2N1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprsB0V2N1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PtprsB0V2N1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprsB0V2N1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PtprsB0V2N1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprsB0V2N1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprsB0V2N1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprsB0V2N1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtprsB0V2N1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprsB0V2N1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtprsB0V2N1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprsB0V2N1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprsB0V2N1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PtprsB0V2N1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtprsB0V2N1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprsB0V2N1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprsB0V2N1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprsB0V2N1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprsB0V2N1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprsB0V2N1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprsB0V2N1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprsB0V2N1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PtprsB0V2N1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PtprsB0V2N1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PtprsB0V2N1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PtprsB0V2N1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PtprsB0V2N1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PtprsB0V2N1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PtprsB0V2N1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PtprsB0V2N1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PtprsB0V2N1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PtprsB0V2N1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprsB0V2N1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PtprsB0V2N1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprsB0V2N1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PtprsB0V2N1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PtprsB0V2N1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprsB0V2N1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprsB0V2N1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprsB0V2N1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PtprsB0V2N1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PtprsB0V2N1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprsB0V2N1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprsB0V2N1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprsB0V2N1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprsB0V2N1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtprsB0V2N1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprsB0V2N1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprsB0V2N1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprsB0V2N1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprsB0V2N1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PtprsB0V2N1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PtprsB0V2N1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprsB0V2N1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprsB0V2N1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprsB0V2N1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprsB0V2N1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprsB0V2N1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprsB0V2N1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprsB0V2N1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprsB0V2N1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprsB0V2N1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprsB0V2N1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprsB0V2N1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprsB0V2N1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprsB0V2N1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprsB0V2N1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprsB0V2N1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprsB0V2N1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprsB0V2N1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprsB0V2N1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
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